18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0485 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0485  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  378  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6344  hypothetical protein  36.36 
 
 		 169 aa  104  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0222  hypothetical protein  38.28 
 
 		 149 aa  84.3  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.84974 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2706  hypothetical protein  33.09 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22270  conserved hypothetical protein TIGR02246  37.37 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1411  hypothetical protein  28.68 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.506922  normal  0.16936 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0401  hypothetical protein  25.17 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00235213  decreased coverage  0.00197507 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4952  hypothetical protein  31.5 
 
 		 138 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.921168 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4756  hypothetical protein  26.02 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120853  hitchhiker  0.00152063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0266  hypothetical protein  30.07 
 
 		 156 aa  51.6  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0794  hypothetical protein  34.34 
 
 		 130 aa  51.2  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.380481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3645  hypothetical protein  28.46 
 
 		 140 aa  51.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0300635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6380  hypothetical protein  28.46 
 
 		 140 aa  51.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219202  normal  0.0893608 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0704  hypothetical protein  31.93 
 
 		 130 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2119  hypothetical protein  34.34 
 
 		 130 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.730613  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0092  hypothetical protein  29.5 
 
 		 203 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6975  hypothetical protein  26.98 
 
 		 143 aa  47.8  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3320  hypothetical protein  27.01 
 
 		 149 aa  45.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.666463  normal  0.0554869 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>