19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6344 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6344  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  345  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0485  hypothetical protein  36.36 
 
 		 185 aa  104  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0222  hypothetical protein  27.78 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.84974 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2706  hypothetical protein  29.23 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4952  hypothetical protein  31.5 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.921168 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0266  hypothetical protein  31.08 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6975  hypothetical protein  28.68 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3320  hypothetical protein  32.35 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.666463  normal  0.0554869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0878  hypothetical protein  28.79 
 
 		 135 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4756  hypothetical protein  26.09 
 
 		 134 aa  52.4  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120853  hitchhiker  0.00152063 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22270  conserved hypothetical protein TIGR02246  32.63 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0230  hypothetical protein  29.93 
 
 		 147 aa  48.9  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2088  hypothetical protein  26.67 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.520251  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1411  hypothetical protein  24.37 
 
 		 145 aa  44.3  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.506922  normal  0.16936 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0401  hypothetical protein  28.21 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00235213  decreased coverage  0.00197507 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0092  hypothetical protein  26.51 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3645  hypothetical protein  27.48 
 
 		 140 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0300635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6380  hypothetical protein  27.41 
 
 		 140 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219202  normal  0.0893608 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0794  hypothetical protein  21.21 
 
 		 130 aa  40.8  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.380481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>