20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4756 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4756  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  272  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120853  hitchhiker  0.00152063 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2706  hypothetical protein  43.55 
 
 
163 aa  99  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0266  hypothetical protein  37.5 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4952  hypothetical protein  35.54 
 
 
138 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.921168 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2088  hypothetical protein  33.63 
 
 
136 aa  63.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.520251  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1840  hypothetical protein  40 
 
 
157 aa  61.6  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  0.0473019 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0092  hypothetical protein  29.37 
 
 
203 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175282  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6975  hypothetical protein  34.51 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0485  hypothetical protein  26.02 
 
 
185 aa  55.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0222  hypothetical protein  31.36 
 
 
149 aa  52.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.84974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6344  hypothetical protein  26.09 
 
 
169 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0401  hypothetical protein  32.99 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00235213  decreased coverage  0.00197507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7088  hypothetical protein  31.25 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3645  hypothetical protein  22.4 
 
 
140 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0300635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6380  hypothetical protein  22.4 
 
 
140 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219202  normal  0.0893608 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0230  hypothetical protein  25 
 
 
147 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1147  hypothetical protein  30.59 
 
 
156 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000230481  hitchhiker  0.0000000000000469186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0878  hypothetical protein  28.7 
 
 
135 aa  43.9  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0246  hypothetical protein  23.21 
 
 
171 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4015  hypothetical protein  35.48 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0362745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>