27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2706 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2706  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  327  3e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0092  hypothetical protein  37.04 
 
 
203 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175282  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4756  hypothetical protein  43.55 
 
 
134 aa  99  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120853  hitchhiker  0.00152063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4952  hypothetical protein  38.89 
 
 
138 aa  94  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.921168 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0266  hypothetical protein  39.84 
 
 
156 aa  92.8  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6975  hypothetical protein  35.77 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0246  hypothetical protein  36.51 
 
 
171 aa  80.1  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1311  hypothetical protein  32.77 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6380  hypothetical protein  30.77 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219202  normal  0.0893608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3645  hypothetical protein  30.77 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0300635 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1840  hypothetical protein  43.65 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  0.0473019 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0485  hypothetical protein  33.09 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2088  hypothetical protein  30.17 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.520251  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3320  hypothetical protein  31.3 
 
 
149 aa  63.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.666463  normal  0.0554869 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0222  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.84974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2709  hypothetical protein  31.75 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.983516  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0401  hypothetical protein  27.61 
 
 
157 aa  61.6  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00235213  decreased coverage  0.00197507 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6344  hypothetical protein  29.23 
 
 
169 aa  59.7  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2076  hypothetical protein  29.27 
 
 
154 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0925  hypothetical protein  32.38 
 
 
317 aa  55.1  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7088  hypothetical protein  31.06 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0230  hypothetical protein  30.47 
 
 
147 aa  48.5  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1147  hypothetical protein  27.94 
 
 
156 aa  47.4  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000230481  hitchhiker  0.0000000000000469186 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1411  hypothetical protein  29.46 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.506922  normal  0.16936 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3861  hypothetical protein  29.41 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.065889  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0074  hypothetical protein  31.3 
 
 
134 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3586  hypothetical protein  31.75 
 
 
174 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>