14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3645 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3645  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  288  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0300635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6380  hypothetical protein  98.57 
 
 
140 aa  285  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219202  normal  0.0893608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6975  hypothetical protein  53.57 
 
 
143 aa  148  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4952  hypothetical protein  52.71 
 
 
138 aa  143  9e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.921168 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2088  hypothetical protein  51.82 
 
 
136 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.520251  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2709  hypothetical protein  53.68 
 
 
139 aa  110  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.983516  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2706  hypothetical protein  30.77 
 
 
163 aa  76.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7088  hypothetical protein  34.23 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0092  hypothetical protein  30.16 
 
 
203 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175282  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0485  hypothetical protein  28.46 
 
 
185 aa  51.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1311  hypothetical protein  23.33 
 
 
148 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4756  hypothetical protein  22.4 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120853  hitchhiker  0.00152063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6344  hypothetical protein  27.48 
 
 
169 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0230  hypothetical protein  27.13 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>