19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6975 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6975  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  285  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4952  hypothetical protein  60.99 
 
 
138 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.921168 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2088  hypothetical protein  65.81 
 
 
136 aa  174  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.520251  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3645  hypothetical protein  53.57 
 
 
140 aa  148  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0300635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6380  hypothetical protein  53.57 
 
 
140 aa  148  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219202  normal  0.0893608 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2709  hypothetical protein  63.49 
 
 
139 aa  147  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.983516  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7088  hypothetical protein  42.2 
 
 
135 aa  94.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2706  hypothetical protein  35.77 
 
 
163 aa  83.2  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0092  hypothetical protein  30.4 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175282  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1311  hypothetical protein  27.5 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4756  hypothetical protein  34.51 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120853  hitchhiker  0.00152063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6344  hypothetical protein  28.68 
 
 
169 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0246  hypothetical protein  28.33 
 
 
171 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0222  hypothetical protein  31.78 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.84974 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0485  hypothetical protein  26.98 
 
 
185 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0878  hypothetical protein  25.24 
 
 
135 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0794  hypothetical protein  26.25 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.380481 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0704  hypothetical protein  28.79 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0664  hypothetical protein  30.08 
 
 
148 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>