15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2709 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2709  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  283  4e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.983516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6975  hypothetical protein  63.49 
 
 		 143 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4952  hypothetical protein  56.3 
 
 		 138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.921168 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2088  hypothetical protein  59.48 
 
 		 136 aa  152  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.520251  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3645  hypothetical protein  48.55 
 
 		 140 aa  133  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0300635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6380  hypothetical protein  51.59 
 
 		 140 aa  133  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219202  normal  0.0893608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7088  hypothetical protein  39.82 
 
 		 135 aa  90.5  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2706  hypothetical protein  31.75 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0222  hypothetical protein  31.01 
 
 		 149 aa  50.4  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.84974 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4756  hypothetical protein  32.43 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120853  hitchhiker  0.00152063 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0794  hypothetical protein  35.06 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.380481 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2119  hypothetical protein  33.77 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.730613  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1311  hypothetical protein  24.17 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0704  hypothetical protein  31.17 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0092  hypothetical protein  22.3 
 
 		 203 aa  42  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175282  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>