71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3500 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3500  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  363  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0357475  normal  0.416536 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4572  putative transmembrane protein  100 
 
 		 173 aa  363  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.686255  normal  0.728328 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4200  transmembrane protein  72.83 
 
 		 171 aa  270  8.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5584  hypothetical protein  68.42 
 
 		 170 aa  244  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4746  lipoprotein transmembrane  65.97 
 
 		 171 aa  214  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.398301  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0919  hypothetical protein  57.69 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.600843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0954  lipoprotein transmembrane  52.23 
 
 		 175 aa  176  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1899  hypothetical protein  47.77 
 
 		 201 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  0.292321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2222  putative transmembrane protein  48.67 
 
 		 150 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.605647 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1374  putative lipoprotein transmembrane  48.1 
 
 		 172 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.399659  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2071  hypothetical protein  47.02 
 
 		 173 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1438  lipoprotein transmembrane  46.11 
 
 		 172 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44922  normal  0.565531 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1480  lipoprotein transmembrane  48.32 
 
 		 177 aa  128  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.028098  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3222  putative lipoprotein  43.71 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6448  putative lipoprotein  43.31 
 
 		 168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.961477  normal  0.265781 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1053  putative lipoprotein  42.07 
 
 		 216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000833656  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1336  putative lipoprotein  39.51 
 
 		 183 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.130729  normal  0.043389 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5584  hypothetical protein  42.07 
 
 		 170 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60834  normal  0.68228 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2016  putative lipoprotein  42.76 
 
 		 174 aa  110  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0546155  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2280  hypothetical protein  40.85 
 
 		 170 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282799  normal  0.210779 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1644  hypothetical protein  40.85 
 
 		 170 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2256  hypothetical protein  40.85 
 
 		 170 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1838  putative lipoprotein  43.85 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1289  putative lipoprotein  43.85 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2173  hypothetical protein  44.62 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0404  putative lipoprotein  43.85 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1282  putative lipoprotein  43.85 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0745  putative lipoprotein  43.85 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1121  putative lipoprotein  43.85 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2294  hypothetical protein  44.62 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1427  putative lipoprotein  43.85 
 
 		 179 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1021  hypothetical protein  44.62 
 
 		 170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.704732 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4052  putative lipoprotein transmembrane  35.8 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3397  putative lipoprotein transmembrane  35.56 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.504524  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0832  putative lipoprotein transmembrane  36.8 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2130  hypothetical protein  34.09 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.657299 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4286  hypothetical protein  30.67 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1150  hypothetical protein  30.86 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.35893 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2734  putative lipoprotein  34.75 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1174  hypothetical protein  30.86 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496107  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2793  putative lipoprotein  34.75 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.571762  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2854  putative lipoprotein  34.75 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0695  hypothetical protein  30.86 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127782  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5112  putative lipoprotein transmembrane  33.33 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1770  putative lipoprotein  33.9 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1053  hypothetical protein  33.9 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1056  hypothetical protein  30.67 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1356  hypothetical protein  32.56 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0268  putative lipoprotein transmembrane  30.99 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2191  lipoprotein  30.37 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.768986  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2770  hypothetical protein  28.24 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.172738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1794  putative lipoprotein  30.51 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0673  lipoprotein  29.37 
 
 		 182 aa  57.4  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2382  lipoprotein  28.68 
 
 		 180 aa  57  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.0101048 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2595  putative lipoprotein  30.37 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0388  putative lipoprotein transmembrane  38.27 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2813  putative lipoprotein  27.74 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3490  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.212629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4089  putative lipoprotein  27.21 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1552  putative lipoprotein  24.84 
 
 		 183 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2929  putative lipoprotein  28.32 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.251431 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3837  hypothetical protein  27.5 
 
 		 189 aa  52.4  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139182  normal  0.877225 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4689  putative lipoprotein transmembrane  28.68 
 
 		 167 aa  51.6  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1840  putative lipoprotein  24.03 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0582073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0604  lipoprotein  25.76 
 
 		 163 aa  45.1  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3111  hypothetical protein  29.82 
 
 		 168 aa  44.3  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0047  hypothetical protein  25.22 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0908  putative lipoprotein  26.82 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4094  hypothetical protein  27.27 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0959  putative lipoprotein  26.98 
 
 		 170 aa  41.6  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  27.88 
 
 		 310 aa  40.8  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>