71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1056 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1056  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  380  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4286  hypothetical protein  95.14 
 
 		 185 aa  361  3e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1174  hypothetical protein  95.68 
 
 		 202 aa  359  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496107  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0695  hypothetical protein  95.68 
 
 		 202 aa  359  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127782  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1150  hypothetical protein  95.68 
 
 		 184 aa  359  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.35893 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1053  hypothetical protein  98.85 
 
 		 174 aa  354  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2130  hypothetical protein  93.51 
 
 		 185 aa  343  8e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.657299 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2854  putative lipoprotein  77.72 
 
 		 269 aa  293  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1770  putative lipoprotein  77.17 
 
 		 184 aa  292  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2734  putative lipoprotein  77.72 
 
 		 196 aa  290  6e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2793  putative lipoprotein  77.72 
 
 		 196 aa  290  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.571762  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1794  putative lipoprotein  61.2 
 
 		 193 aa  241  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2929  putative lipoprotein  62.43 
 
 		 183 aa  240  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.251431 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1552  putative lipoprotein  62.43 
 
 		 183 aa  240  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2595  putative lipoprotein  51.45 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154959 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2770  hypothetical protein  46.96 
 
 		 200 aa  167  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.172738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0673  lipoprotein  49.13 
 
 		 182 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2382  lipoprotein  49.71 
 
 		 180 aa  166  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.0101048 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2191  lipoprotein  48.55 
 
 		 180 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.768986  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1840  putative lipoprotein  39.44 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0582073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3490  putative lipoprotein  38.73 
 
 		 166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.212629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2813  putative lipoprotein  38.73 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4089  putative lipoprotein  36.05 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0604  lipoprotein  38.15 
 
 		 163 aa  97.8  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3837  hypothetical protein  39.44 
 
 		 189 aa  95.5  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139182  normal  0.877225 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0908  putative lipoprotein  35.71 
 
 		 173 aa  92.4  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0959  putative lipoprotein  34.62 
 
 		 170 aa  92  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3111  hypothetical protein  48 
 
 		 168 aa  90.9  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0047  hypothetical protein  36 
 
 		 164 aa  85.9  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4689  putative lipoprotein transmembrane  32.8 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1356  hypothetical protein  36.54 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2222  putative transmembrane protein  35.04 
 
 		 150 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.605647 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4094  hypothetical protein  38.18 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2071  hypothetical protein  35 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0832  putative lipoprotein transmembrane  35.34 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3397  putative lipoprotein transmembrane  33.61 
 
 		 171 aa  67  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.504524  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4052  putative lipoprotein transmembrane  32.54 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0605  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4746  lipoprotein transmembrane  31.75 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.398301  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6448  putative lipoprotein  31.15 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.961477  normal  0.265781 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3222  putative lipoprotein  31.71 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3500  hypothetical protein  33.9 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0357475  normal  0.416536 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4572  putative transmembrane protein  33.9 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.686255  normal  0.728328 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1021  hypothetical protein  31.67 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.704732 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1336  putative lipoprotein  30.08 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.130729  normal  0.043389 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2256  hypothetical protein  30.89 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1644  hypothetical protein  30.89 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2280  hypothetical protein  30.89 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282799  normal  0.210779 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1899  hypothetical protein  32.85 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  0.292321 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2294  hypothetical protein  30.89 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075396  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2173  hypothetical protein  30.89 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1374  putative lipoprotein transmembrane  32.31 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.399659  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5584  hypothetical protein  30.08 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60834  normal  0.68228 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2016  putative lipoprotein  30.08 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0546155  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4200  transmembrane protein  28.05 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1438  lipoprotein transmembrane  31.54 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44922  normal  0.565531 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1053  putative lipoprotein  31.03 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000833656  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0268  putative lipoprotein transmembrane  34.83 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1838  putative lipoprotein  29.17 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5584  hypothetical protein  28.57 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1427  putative lipoprotein  29.17 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1121  putative lipoprotein  29.17 
 
 		 166 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0404  putative lipoprotein  29.17 
 
 		 166 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0745  putative lipoprotein  29.17 
 
 		 166 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1282  putative lipoprotein  29.17 
 
 		 166 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1289  putative lipoprotein  29.17 
 
 		 166 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5112  putative lipoprotein transmembrane  27.69 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1480  lipoprotein transmembrane  31.54 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.028098  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0388  putative lipoprotein transmembrane  32 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0954  lipoprotein transmembrane  27.48 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0919  hypothetical protein  26.36 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.600843  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>