70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2071 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2071  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  358  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1899  hypothetical protein  85.06 
 
 		 201 aa  287  4e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  0.292321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2222  putative transmembrane protein  85.81 
 
 		 150 aa  273  9e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.605647 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1480  lipoprotein transmembrane  67.83 
 
 		 177 aa  199  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.028098  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1374  putative lipoprotein transmembrane  64.43 
 
 		 172 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.399659  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1438  lipoprotein transmembrane  63.09 
 
 		 172 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44922  normal  0.565531 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0954  lipoprotein transmembrane  50.94 
 
 		 175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0919  hypothetical protein  43.9 
 
 		 177 aa  153  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.600843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6448  putative lipoprotein  46.71 
 
 		 168 aa  148  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.961477  normal  0.265781 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3222  putative lipoprotein  46.54 
 
 		 183 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1336  putative lipoprotein  43.9 
 
 		 183 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.130729  normal  0.043389 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1053  putative lipoprotein  49.26 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000833656  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1427  putative lipoprotein  50 
 
 		 179 aa  141  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1121  putative lipoprotein  50 
 
 		 166 aa  140  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0745  putative lipoprotein  50 
 
 		 166 aa  140  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1282  putative lipoprotein  50 
 
 		 166 aa  140  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1289  putative lipoprotein  50 
 
 		 166 aa  140  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0404  putative lipoprotein  50 
 
 		 166 aa  140  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1838  putative lipoprotein  50 
 
 		 170 aa  141  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2016  putative lipoprotein  47.3 
 
 		 174 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0546155  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1021  hypothetical protein  48.12 
 
 		 170 aa  136  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.704732 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2280  hypothetical protein  47.79 
 
 		 170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282799  normal  0.210779 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1644  hypothetical protein  47.79 
 
 		 170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5584  hypothetical protein  48.12 
 
 		 170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60834  normal  0.68228 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2256  hypothetical protein  47.79 
 
 		 170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2173  hypothetical protein  47.79 
 
 		 170 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2294  hypothetical protein  47.06 
 
 		 170 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075396  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4200  transmembrane protein  42.6 
 
 		 171 aa  132  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3500  hypothetical protein  46.62 
 
 		 173 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0357475  normal  0.416536 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4572  putative transmembrane protein  46.62 
 
 		 173 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.686255  normal  0.728328 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5584  hypothetical protein  42.33 
 
 		 170 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4746  lipoprotein transmembrane  42.45 
 
 		 171 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.398301  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0832  putative lipoprotein transmembrane  36.09 
 
 		 179 aa  84.7  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2854  putative lipoprotein  39.17 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4052  putative lipoprotein transmembrane  32.34 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2793  putative lipoprotein  39.17 
 
 		 196 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.571762  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1770  putative lipoprotein  38.33 
 
 		 184 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2734  putative lipoprotein  39.17 
 
 		 196 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5112  putative lipoprotein transmembrane  34.38 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3397  putative lipoprotein transmembrane  33.83 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.504524  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2929  putative lipoprotein  35.45 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.251431 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1552  putative lipoprotein  35.45 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2770  hypothetical protein  33.61 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.172738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4689  putative lipoprotein transmembrane  39.25 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1794  putative lipoprotein  35 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2130  hypothetical protein  36.67 
 
 		 185 aa  72  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.657299 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1356  hypothetical protein  33.08 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1150  hypothetical protein  35 
 
 		 184 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.35893 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1174  hypothetical protein  35 
 
 		 202 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496107  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0695  hypothetical protein  35 
 
 		 202 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127782  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4286  hypothetical protein  35 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2595  putative lipoprotein  31.71 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154959 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0673  lipoprotein  31.62 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1056  hypothetical protein  35 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2191  lipoprotein  33.62 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.768986  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1053  hypothetical protein  35 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0388  putative lipoprotein transmembrane  33.77 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4094  hypothetical protein  35.48 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4089  putative lipoprotein  33.88 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0268  putative lipoprotein transmembrane  31.9 
 
 		 162 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3111  hypothetical protein  34.78 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2382  lipoprotein  30.08 
 
 		 180 aa  62  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.0101048 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2813  putative lipoprotein  28.22 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3490  putative lipoprotein  28.22 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.212629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3837  hypothetical protein  31.86 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139182  normal  0.877225 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1840  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0582073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0047  hypothetical protein  26.23 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0959  putative lipoprotein  31.4 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0908  putative lipoprotein  31.71 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0604  lipoprotein  26.15 
 
 		 163 aa  48.5  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>