43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0604 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0604  lipoprotein  100 
 
 
163 aa  339  8e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0047  hypothetical protein  46.94 
 
 
164 aa  143  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1840  putative lipoprotein  45.39 
 
 
165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0582073  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3490  putative lipoprotein  47.02 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.212629  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2813  putative lipoprotein  46.36 
 
 
166 aa  124  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3837  hypothetical protein  44.14 
 
 
189 aa  122  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139182  normal  0.877225 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4089  putative lipoprotein  43.84 
 
 
157 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0908  putative lipoprotein  45.96 
 
 
173 aa  121  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2770  hypothetical protein  44.2 
 
 
200 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.172738  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0959  putative lipoprotein  42.24 
 
 
170 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2382  lipoprotein  45.26 
 
 
180 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.0101048 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1794  putative lipoprotein  44.53 
 
 
193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0673  lipoprotein  43.48 
 
 
182 aa  110  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2191  lipoprotein  40.88 
 
 
180 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.768986  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1552  putative lipoprotein  40.88 
 
 
183 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2929  putative lipoprotein  40.88 
 
 
183 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.251431 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2595  putative lipoprotein  41.61 
 
 
180 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.154959 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1770  putative lipoprotein  42.03 
 
 
184 aa  101  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2854  putative lipoprotein  42.75 
 
 
269 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2734  putative lipoprotein  42.75 
 
 
196 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2793  putative lipoprotein  42.75 
 
 
196 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.571762  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1056  hypothetical protein  38.15 
 
 
185 aa  97.8  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2130  hypothetical protein  42.75 
 
 
185 aa  97.8  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.657299 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1174  hypothetical protein  37.79 
 
 
202 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496107  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1150  hypothetical protein  37.79 
 
 
184 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.35893 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1053  hypothetical protein  42.75 
 
 
174 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0695  hypothetical protein  37.79 
 
 
202 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127782  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4286  hypothetical protein  37.57 
 
 
185 aa  94.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0605  hypothetical protein  35.85 
 
 
207 aa  86.3  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1356  hypothetical protein  30.19 
 
 
172 aa  73.9  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4094  hypothetical protein  28.93 
 
 
178 aa  57.4  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3111  hypothetical protein  34.78 
 
 
168 aa  54.3  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2071  hypothetical protein  27.55 
 
 
173 aa  48.5  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2222  putative transmembrane protein  27.08 
 
 
150 aa  47.8  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.605647 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4200  transmembrane protein  23.65 
 
 
171 aa  47.8  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4052  putative lipoprotein transmembrane  27.34 
 
 
171 aa  45.8  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0832  putative lipoprotein transmembrane  29.41 
 
 
179 aa  45.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1899  hypothetical protein  26.04 
 
 
201 aa  44.3  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  0.292321 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5112  putative lipoprotein transmembrane  28 
 
 
166 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5584  hypothetical protein  25 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3397  putative lipoprotein transmembrane  26.42 
 
 
171 aa  42.4  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.504524  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1438  lipoprotein transmembrane  29.03 
 
 
172 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44922  normal  0.565531 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1374  putative lipoprotein transmembrane  29.03 
 
 
172 aa  41.2  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.399659  normal  0.101597 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>