38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0605 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0605  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  425  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0047  hypothetical protein  42.74 
 
 
164 aa  88.2  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0604  lipoprotein  35.85 
 
 
163 aa  86.3  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3490  putative lipoprotein  38.78 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.212629  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2813  putative lipoprotein  36.99 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1840  putative lipoprotein  36.89 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0582073  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1770  putative lipoprotein  36.22 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2854  putative lipoprotein  35.43 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2793  putative lipoprotein  35.43 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.571762  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2734  putative lipoprotein  35.43 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3837  hypothetical protein  36.29 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139182  normal  0.877225 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2382  lipoprotein  37.6 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.0101048 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1053  hypothetical protein  33.33 
 
 
174 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1056  hypothetical protein  33.33 
 
 
185 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0695  hypothetical protein  34.65 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127782  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1174  hypothetical protein  34.65 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496107  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1150  hypothetical protein  34.65 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.35893 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0673  lipoprotein  34.68 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2595  putative lipoprotein  36.29 
 
 
180 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.154959 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4286  hypothetical protein  33.86 
 
 
185 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2130  hypothetical protein  33.86 
 
 
185 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.657299 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2929  putative lipoprotein  34.92 
 
 
183 aa  62  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.251431 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1552  putative lipoprotein  34.65 
 
 
183 aa  62  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2191  lipoprotein  33.87 
 
 
180 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.768986  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1794  putative lipoprotein  33.06 
 
 
193 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2770  hypothetical protein  33.87 
 
 
200 aa  58.9  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.172738  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0959  putative lipoprotein  30.5 
 
 
170 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0908  putative lipoprotein  31.21 
 
 
173 aa  52.8  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0268  putative lipoprotein transmembrane  38.2 
 
 
162 aa  52  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4089  putative lipoprotein  30.63 
 
 
157 aa  48.9  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4094  hypothetical protein  30 
 
 
178 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1356  hypothetical protein  27.91 
 
 
172 aa  46.6  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3111  hypothetical protein  28.57 
 
 
168 aa  45.8  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0832  putative lipoprotein transmembrane  30.83 
 
 
179 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5112  putative lipoprotein transmembrane  41.1 
 
 
166 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4052  putative lipoprotein transmembrane  28.1 
 
 
171 aa  42.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2222  putative transmembrane protein  28.28 
 
 
150 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.605647 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3222  putative lipoprotein  26.39 
 
 
183 aa  41.6  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>