15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3555 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4631  Phenol hydroxylase subunit  100 
 
 		 69 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3555  Phenol hydroxylase subunit  100 
 
 		 69 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5680  phenol hydroxylase subunit  79.66 
 
 		 69 aa  104  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3363  phenol hydroxylase subunit  61.67 
 
 		 76 aa  79  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2796  phenol hydroxylase subunit  60 
 
 		 80 aa  75.5  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0206  phenol hydroxylase subunit  54.39 
 
 		 71 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3116  Phenol hydroxylase subunit  54.24 
 
 		 89 aa  67.4  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185842  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3797  phenol hydroxylase subunit  44.44 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.070341  hitchhiker  0.00219464 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1331  phenol hydroxylase subunit  45.61 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.658986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2971  phenol hydroxylase subunit  53.7 
 
 		 76 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3309  phenol hydrolase assembly protein  52.17 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.143126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30760  Multi-component phenol hydoxylase, assembly subunit; LapK  40.74 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08860  Phenol hydroxylase subunit DmpK  46.67 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2285  phenol hydrolase assembly protein  52.63 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3311  phenol hydroxylase subunit  50 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>