18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3551 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3551  Phenol hydroxylase conserved region  100 
 
 		 121 aa  253  7e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4627  Phenol hydroxylase conserved region  100 
 
 		 121 aa  253  7e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5684  phenol hydroxylase region  82.79 
 
 		 122 aa  217  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3359  phenol hydroxylase region  76.86 
 
 		 118 aa  194  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0210  phenol hydroxylase region  78.51 
 
 		 118 aa  192  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2792  phenol hydroxylase region  77.31 
 
 		 118 aa  189  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.299965 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1327  phenol hydroxylase region  73.55 
 
 		 118 aa  184  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2967  phenol hydroxylase region  67.89 
 
 		 118 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3112  Phenol hydroxylase conserved region  58.41 
 
 		 119 aa  140  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2281  phenol hydrolase gammma subunit  60.36 
 
 		 120 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3305  phenol hydrolase gammma subunit  52.78 
 
 		 120 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1783  phenol hydroxylase region  51.35 
 
 		 120 aa  124  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.78708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1703  phenol hydroxylase region  50.45 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.395752  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3793  phenol hydroxylase region  42.73 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000826781  hitchhiker  0.00225505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3307  phenol hydroxylase region  46.6 
 
 		 119 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08820  Phenol hydroxylase subunit P4  46.15 
 
 		 119 aa  99.4  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786664  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30720  Multi-component phenol hydoxylase, gamma subunit; LapO  45.54 
 
 		 118 aa  98.6  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51766  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0527  phenol hydroxylase subunit P4  30 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>