51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3560 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4636  methane/phenol/toluene hydroxylase  100 
 
 		 329 aa  675    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3560  methane/phenol/toluene hydroxylase  100 
 
 		 329 aa  675    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5675  methane/phenol/toluene hydroxylase  88.75 
 
 		 332 aa  607  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0818  toluene monooxygenase beta subunit  72.17 
 
 		 328 aa  501  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1312  methane/phenol/toluene hydroxylase  70.64 
 
 		 328 aa  494  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3816  methane/phenol/toluene hydroxylase  70.03 
 
 		 328 aa  493  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126401  normal  0.061114 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2543  toluene monooxygenase beta subunit  68.81 
 
 		 328 aa  475  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0215  methane/phenol/toluene hydroxylase  44.84 
 
 		 341 aa  257  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4861  methane/phenol/toluene hydroxylase  38.68 
 
 		 341 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.071764 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0542  methane/phenol/toluene hydroxylase  34.51 
 
 		 378 aa  197  3e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0947319  normal  0.353657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1594  putative methane/phenol/toluene hydroxylase (monooxygenase)  35.49 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392332  normal  0.716705 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2200  methane/phenol/toluene hydroxylase  30.28 
 
 		 376 aa  166  4e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929517  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4809  methane monooxygenase  28.63 
 
 		 349 aa  89.4  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3115  Phenol 2-monooxygenase  27.27 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2518  methane/phenol/toluene hydroxylase  27.4 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.692881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2284  phenol hydrolase beta subunit  24.37 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3310  phenol 2-monooxygenase  25.69 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3796  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.03 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0518853  hitchhiker  0.00260519 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2795  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.97 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08850  Phenol hydroxylase subunit P1  24.33 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1330  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.76 
 
 		 331 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5681  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.84 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1379  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.83 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.633988  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1700  methane/phenol/toluene hydroxylase  28.03 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1786  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.49 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3554  Phenol 2-monooxygenase  23.55 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4630  Phenol 2-monooxygenase  23.55 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2794  putative monooxygenase beta subunit  25.21 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3362  phenol 2-monooxygenase  24.37 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1506  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.21 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.324746 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0207  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.4 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3308  phenol hydrolase beta subunit  23.47 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30750  Multi-component phenol hydoxylase, beta subunit; LapL  23.58 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4409  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.91 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0524  Phenol 2-monooxygenase  26.1 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2970  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.16 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1649  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.48 
 
 		 357 aa  52.8  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0952  propane monoxygenase hydroxylase small subunit  22.22 
 
 		 365 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3632  putative methane/phenol/toluene monooxygenase (A subunit, beta chain)  22.77 
 
 		 364 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.564213 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3360  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.83 
 
 		 528 aa  50.8  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1262  Methane monooxygenase  22.27 
 
 		 526 aa  50.4  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3306  phenol hydrolase alpha subunit  22.22 
 
 		 537 aa  49.7  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1702  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  21.16 
 
 		 530 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183205  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1784  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.13 
 
 		 515 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3553  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.99 
 
 		 368 aa  47  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401099  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3395  methane/phenol/toluene hydroxylase  20.08 
 
 		 361 aa  46.2  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.089822 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1194  methane monooxygenase, A subunit, alpha chain  20.67 
 
 		 527 aa  45.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.549578  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2968  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.79 
 
 		 516 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0281333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2282  phenol hydrolase alpha subunit  22.12 
 
 		 527 aa  44.3  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2793  methane/phenol/toluene hydroxylase  20.09 
 
 		 519 aa  43.5  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.368965 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0209  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.4 
 
 		 514 aa  43.1  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>