232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3537 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3537  Phospholipase C  100 
 
 
474 aa  967    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4613  Phospholipase C  100 
 
 
474 aa  967    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5961  phosphoesterase  55.6 
 
 
497 aa  498  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6095  phosphoesterase  51.91 
 
 
503 aa  481  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5381  phosphoesterase  53.86 
 
 
492 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5529  phosphoesterase  54.09 
 
 
485 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0242693 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3544  phosphoesterase  53.64 
 
 
492 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.559164  normal  0.930928 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3201  phosphoesterase  52.46 
 
 
434 aa  410  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.78084  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0731  phospholipase C  28.88 
 
 
465 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1812  phosphoesterase family protein  31.59 
 
 
495 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1268  phosphoesterase family protein  31.07 
 
 
506 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1792  phosphoesterase family protein  31.59 
 
 
495 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.141454  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1966  phosphoesterase family protein  31.07 
 
 
506 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.456535  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0331  phosphoesterase family protein  27.31 
 
 
486 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1863  phosphoesterase family protein  27.19 
 
 
486 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.360033  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1778  phosphoesterase family protein  27.31 
 
 
486 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100601  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0968  phosphoesterase family protein  27.31 
 
 
486 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.592914  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1368  phosphoesterase family protein  27.31 
 
 
463 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.468542  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1027  phosphoesterase family protein  31.07 
 
 
495 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.041262  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0411  phosphoesterase family protein  27.31 
 
 
463 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1756  phosphoesterase family protein  31.07 
 
 
495 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.480824  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0230  phosphoesterase family protein  27.31 
 
 
463 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0140  phosphoesterase family protein  31.07 
 
 
495 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.802168  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2871  phospholipase C  33.43 
 
 
484 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.971019 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4181  phospholipase C  27.43 
 
 
522 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.508071 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4899  Phospholipase C  29.92 
 
 
469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.683762  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7067  phospholipase C  30.81 
 
 
548 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5955  Phospholipase C  30.24 
 
 
485 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.599431  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5107  phospholipase C, phosphocholine-specific  28.4 
 
 
687 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1106  phosphoesterase family protein  27.82 
 
 
463 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.568201  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12373  phospholipase C 3 plcC  29.44 
 
 
516 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.74886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0605  Phospholipase C  28.64 
 
 
542 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437604  normal  0.560957 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5185  Phospholipase C  30.36 
 
 
457 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11775  phospholipase C plcD  29.31 
 
 
514 aa  127  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.54907e-25  hitchhiker  0.000000000734426 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6306  phospholipase C  30 
 
 
706 aa  126  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0180  phospholipase C, phosphocholine-specific  29.48 
 
 
686 aa  126  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5037  phospholipase C, phosphocholine-specific  29.48 
 
 
704 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911407  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3132  twin-arginine translocation pathway signal  29.48 
 
 
704 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5235  phospholipase C  29.48 
 
 
704 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.82633 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2951  phospholipase C, phosphocholine-specific  29.51 
 
 
705 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0428  phosphoesterase  29.24 
 
 
704 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3003  phospholipase C  28.96 
 
 
706 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2866  phospholipase C, phosphocholine-specific  28.96 
 
 
706 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.770955 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02336  hypothetical protein similar to phospholipase C PLC-C (Eurofung)  28.91 
 
 
466 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.682737  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0372  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  28.64 
 
 
705 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0549  non-hemolytic phospholipase C precursor  28.64 
 
 
705 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0317  non-hemolytic phospholipase C precursor  28.99 
 
 
742 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7366  phospholipase C, phosphocholine-specific  28.93 
 
 
805 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0358  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  28.64 
 
 
705 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12375  membrane-associated phospholipase C 1 plcA  27 
 
 
520 aa  120  7e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000152266  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1837  phospholipase C, phosphocholine-specific  27.82 
 
 
707 aa  119  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1801  non-hemolytic phospholipase C precursor  28.31 
 
 
692 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07691  phosphoesterase superfamily protein (AFU_orthologue; AFUA_1G17590)  31.97 
 
 
455 aa  118  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.985467  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0211  non-hemolytic phospholipase C  27.99 
 
 
717 aa  118  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08546  phosphatidylglycerol specific phospholipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01530)  31.54 
 
 
508 aa  117  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.24952  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21110  non-hemolytic phospholipase C precursor  27.78 
 
 
692 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7094  phospholipase C, phosphocholine-specific  27.99 
 
 
717 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2139  phospholipase C, phosphocholine-specific  27.8 
 
 
752 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2865  non-hemolytic phospholipase C precursor  27.12 
 
 
903 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2987  phospholipase C, phosphocholine-specific  24.83 
 
 
708 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0584  phospholipase C  27.12 
 
 
700 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2804  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  27.12 
 
 
700 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1743  non-hemolytic phospholipase C  27.12 
 
 
700 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0901585  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4287  twin-arginine translocation pathway signal  27.38 
 
 
711 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.717547  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2858  phospholipase C  27.12 
 
 
700 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2745  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  27.12 
 
 
700 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0687  twin-arginine translocation pathway signal  27.15 
 
 
749 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1166  phospholipase C  27.15 
 
 
714 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371643  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1762  phospholipase C  26.89 
 
 
865 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2708  phospholipase C, phosphocholine-specific  25.74 
 
 
703 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1142  phospholipase C, phosphocholine-specific  26.68 
 
 
714 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1048  phospholipase C, phosphocholine-specific  26.91 
 
 
714 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.898886 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1045  phospholipase C  26.91 
 
 
714 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345589  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3906  phosphoesterase  27.2 
 
 
415 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4462  phosphoesterase  27.2 
 
 
415 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2380  acid phosphatase  25.91 
 
 
438 aa  110  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.733852  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4278  phospholipase C'  26.45 
 
 
749 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309382  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3323  phosphoesterase  26.78 
 
 
1019 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0302  phosphoesterase  25.3 
 
 
717 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0182  phospholipase C, phosphocholine-specific  27.15 
 
 
700 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1415  non-hemolytic phospholipase C  25.28 
 
 
703 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0175  phospholipase C, phosphocholine-specific  25.87 
 
 
700 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6410  phospholipase C, phosphocholine-specific  25.75 
 
 
689 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5840  phosphoesterase  27.08 
 
 
415 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0621062  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3844  Phospholipase C  28.07 
 
 
522 aa  106  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0676329 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1454  phosphoesterase  28.2 
 
 
415 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12374  membrane-associated phospholipase C 2 plcB  28.77 
 
 
521 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02511  Non-hemolytic phospholipase C  25.7 
 
 
655 aa  106  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1494  phospholipase C, phosphocholine-specific  25.54 
 
 
702 aa  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1546  phospholipase C, phosphocholine-specific  26.34 
 
 
704 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6939  phospholipase C  28.65 
 
 
496 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.541284  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3165  phospholipase C, phosphocholine-specific  25.05 
 
 
723 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929176  hitchhiker  0.00780513 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2739  hypothetical protein  25.64 
 
 
651 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0522318  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3050  phospholipase C, phosphocholine-specific  25.97 
 
 
719 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79253  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4198  phospholipase C  26.28 
 
 
715 aa  104  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3083  phospholipase C, phosphocholine-specific  25.56 
 
 
723 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0309151 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2532  twin-arginine translocation pathway signal  25.56 
 
 
723 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3145  phospholipase C  25.56 
 
 
723 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4192  phospholipase C  27.21 
 
 
714 aa  103  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.81751  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0319  non-hemolytic phospholipase C signal peptide protein  25.12 
 
 
700 aa  103  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>