29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3514 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3514  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  137  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4588  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  137  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4365  hypothetical protein  72.73 
 
 		 78 aa  99.4  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3903  hypothetical protein  72.73 
 
 		 78 aa  99.4  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1427  hypothetical protein  72.73 
 
 		 82 aa  98.6  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5836  hypothetical protein  71.21 
 
 		 78 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4466  hypothetical protein  71.21 
 
 		 78 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3902  hypothetical protein  71.21 
 
 		 78 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.960527  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1779  plasmid stability protein, putative  54.55 
 
 		 84 aa  51.6  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1455  plasmid stability protein-like protein  54.55 
 
 		 84 aa  51.6  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0948789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6536  putative plasmid stability protein  56.82 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0896762 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3576  hypothetical protein  62.5 
 
 		 81 aa  47  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00242199  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3454  plasmid stabilization protein  47.27 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2796  plasmid stability protein  60.98 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.485271  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2074  putative plasmid stability protein  36.92 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0207391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0629  hypothetical protein  55 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302428 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0209  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  49.18 
 
 		 485 aa  43.5  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3181  hypothetical protein  57.5 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4150  hypothetical protein  55 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1593  hypothetical protein  60 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.714896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5842  plasmid stability protein StbC  45.45 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4765  plasmid stabilization protein  49.09 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.218672 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0622  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  47.46 
 
 		 485 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.476775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0084  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  54 
 
 		 481 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3475  plasmid stability protein StbC  45.45 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.269317 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2303  plasmid stabilization protein  48.08 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320056  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1881  plasmid stability protein  55 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3696  hypothetical protein  55 
 
 		 81 aa  40.4  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4189  plasmid stability protein-like protein  40.62 
 
 		 91 aa  40  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.848432  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>