30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1427 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1427  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3903  hypothetical protein  94.87 
 
 
78 aa  150  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4365  hypothetical protein  94.87 
 
 
78 aa  150  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3902  hypothetical protein  91.03 
 
 
78 aa  147  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.960527  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4466  hypothetical protein  91.03 
 
 
78 aa  147  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5836  hypothetical protein  91.03 
 
 
78 aa  147  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280378  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4588  hypothetical protein  72.73 
 
 
67 aa  98.6  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3514  hypothetical protein  72.73 
 
 
67 aa  98.6  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264165  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3454  plasmid stabilization protein  47.27 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0209  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  49.18 
 
 
485 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1593  hypothetical protein  51.85 
 
 
81 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.714896  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0622  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  46.77 
 
 
485 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.476775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0084  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  54 
 
 
481 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3475  plasmid stability protein StbC  45.45 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.269317 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1361  plasmid stability protein, putative  51.06 
 
 
97 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15422  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4150  hypothetical protein  46.3 
 
 
82 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1779  plasmid stability protein, putative  40.51 
 
 
84 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1455  plasmid stability protein-like protein  40.51 
 
 
84 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0948789  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4765  plasmid stabilization protein  41.03 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.218672 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4189  plasmid stability protein-like protein  35.21 
 
 
91 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.848432  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2796  plasmid stability protein  46.3 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.485271  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0805  hypothetical protein  37.5 
 
 
87 aa  41.6  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00293347  hitchhiker  0.00716136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0629  hypothetical protein  47.5 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.302428 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23560  hypothetical protein  46.81 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.459233  normal  0.445155 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5842  plasmid stability protein StbC  43.64 
 
 
85 aa  41.2  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2074  putative plasmid stability protein  46.81 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0207391 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3028  hypothetical protein  35.94 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0118317 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4711  plasmid stability protein-like protein  39.13 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.5275 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3576  hypothetical protein  52.5 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00242199  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4618  hypothetical protein  52.5 
 
 
87 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>