53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1593 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1593  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  157  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.714896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4150  hypothetical protein  85.14 
 
 		 82 aa  124  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3576  hypothetical protein  64.86 
 
 		 81 aa  93.6  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00242199  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6536  putative plasmid stability protein  62.16 
 
 		 82 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0896762 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3181  hypothetical protein  67.16 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1881  plasmid stability protein  56 
 
 		 83 aa  72  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4618  hypothetical protein  54.55 
 
 		 87 aa  70.1  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1046  hypothetical protein  50.67 
 
 		 81 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0839246  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3696  hypothetical protein  53.73 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1069  hypothetical protein  51.52 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4027  Resolvase domain protein  53.73 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4211  hypothetical protein  47.22 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176867  normal  0.948533 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1361  plasmid stability protein, putative  50.75 
 
 		 97 aa  57  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15422  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0726  hypothetical protein  48.05 
 
 		 75 aa  57  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0629  hypothetical protein  47.76 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302428 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1965  hypothetical protein  41.67 
 
 		 79 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.30169 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2641  hypothetical protein  42.67 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0043  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  57.45 
 
 		 479 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.658054 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0622  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  58.49 
 
 		 485 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.476775 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0687  hypothetical protein  47.76 
 
 		 103 aa  52  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.153428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0209  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  70.27 
 
 		 485 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0051  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  66.67 
 
 		 479 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0750975  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1877  hypothetical protein  42.37 
 
 		 79 aa  51.2  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0084  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  65 
 
 		 481 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1319  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  66.67 
 
 		 461 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4020  hypothetical protein  38.81 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23560  hypothetical protein  52.54 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.459233  normal  0.445155 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1544  panthotenate metabolism flavoprotein  44.26 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070081 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3903  hypothetical protein  53.7 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4365  hypothetical protein  53.7 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0380  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  66.67 
 
 		 475 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3902  hypothetical protein  53.7 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.960527  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4466  hypothetical protein  53.7 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5836  hypothetical protein  53.7 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1427  hypothetical protein  51.85 
 
 		 82 aa  47.4  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2796  plasmid stability protein  56.1 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.485271  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4335  plasmid stability protein StbC  56.1 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0083  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  56.76 
 
 		 475 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317145 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1779  plasmid stability protein, putative  46.77 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1455  plasmid stability protein-like protein  46.77 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0948789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5670  plasmid stability protein-like protein  53.85 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4189  plasmid stability protein-like protein  52.5 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.848432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3514  hypothetical protein  60 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4588  hypothetical protein  60 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4711  plasmid stability protein-like protein  52.5 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.5275 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4765  plasmid stabilization protein  50 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.218672 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3796  Arc domain-containing protein  47.73 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226949 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2303  plasmid stabilization protein  51.16 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320056  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5842  plasmid stability protein StbC  57.5 
 
 		 85 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0075  hypothetical protein  50 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501463  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3520  putative plasmid stability protein StbC  48.39 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743208 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1215  putative plasmid stability protein StbC  48.39 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0895  plasmid stability protein-like  50 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>