62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4335 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4335  plasmid stability protein StbC  100 
 
 		 84 aa  167  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3768  plasmid stability protein StbC  63.1 
 
 		 84 aa  118  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.411403  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1779  plasmid stability protein, putative  61.9 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1455  plasmid stability protein-like protein  61.9 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0948789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2303  plasmid stabilization protein  61.9 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320056  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5670  plasmid stability protein-like protein  61.45 
 
 		 147 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0895  plasmid stability protein-like  63.1 
 
 		 91 aa  102  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4765  plasmid stabilization protein  60.71 
 
 		 84 aa  102  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.218672 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36410  plasmid stability protein StbC  64.29 
 
 		 71 aa  101  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.937788  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3193  putative plasmid stabilization protein  58.82 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4189  plasmid stability protein-like protein  60.71 
 
 		 91 aa  100  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.848432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3475  plasmid stability protein StbC  61.18 
 
 		 85 aa  99  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.269317 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4675  hypothetical protein  58.33 
 
 		 87 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3028  hypothetical protein  51.19 
 
 		 84 aa  97.8  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0118317 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3796  Arc domain-containing protein  61.9 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226949 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5842  plasmid stability protein StbC  58.82 
 
 		 85 aa  97.1  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4711  plasmid stability protein-like protein  60.71 
 
 		 91 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.5275 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0468  plasmid stability protein StbC  55.29 
 
 		 85 aa  96.3  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1215  putative plasmid stability protein StbC  55.95 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3520  putative plasmid stability protein StbC  55.95 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743208 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0019  plasmid stability protein StbC  55.29 
 
 		 97 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0380378  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2333  plasmid stabilization protein  53.57 
 
 		 84 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.209572 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0727  plasmid stability protein StbC  54.12 
 
 		 85 aa  94  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.460533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3454  plasmid stabilization protein  55.42 
 
 		 85 aa  93.6  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3888  hypothetical protein  48.81 
 
 		 89 aa  89.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3570  hypothetical protein  51.19 
 
 		 83 aa  89.4  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7720  plasmid stability protein  50.6 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3137  plasmid stabilization protein  48.81 
 
 		 84 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384782  normal  0.487759 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2074  putative plasmid stability protein  42.86 
 
 		 79 aa  67  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0207391 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4618  hypothetical protein  47.06 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23560  hypothetical protein  46.48 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.459233  normal  0.445155 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1722  putative stabilization protein  61.9 
 
 		 63 aa  53.5  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1361  plasmid stability protein, putative  55.56 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15422  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3696  hypothetical protein  60.98 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3181  hypothetical protein  58.54 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4020  hypothetical protein  55.81 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4150  hypothetical protein  41.98 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1069  hypothetical protein  48 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1881  plasmid stability protein  53.49 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1544  panthotenate metabolism flavoprotein  56.82 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070081 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4027  Resolvase domain protein  58.54 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1046  hypothetical protein  40 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0839246  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0629  hypothetical protein  60 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302428 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3576  hypothetical protein  53.66 
 
 		 81 aa  47  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00242199  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1593  hypothetical protein  56.1 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.714896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6536  putative plasmid stability protein  53.66 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0896762 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4211  hypothetical protein  51.11 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176867  normal  0.948533 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2641  hypothetical protein  45.45 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0826  hypothetical protein  45.45 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.448113  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0380  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  53.49 
 
 		 475 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1044  plasmid stability protein  36.36 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.718277  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0726  hypothetical protein  49.02 
 
 		 75 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1319  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  50 
 
 		 461 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1965  hypothetical protein  52.63 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.30169 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2796  plasmid stability protein  41.38 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.485271  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0075  hypothetical protein  51.35 
 
 		 122 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501463  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0051  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  53.66 
 
 		 479 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0750975  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0622  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  57.5 
 
 		 485 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.476775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0083  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  47.62 
 
 		 475 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317145 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11981  hypothetical protein  40 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2192  hypothetical protein  41.67 
 
 		 74 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165321  normal  0.341305 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3162  hypothetical protein  35.06 
 
 		 77 aa  40  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>