49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3520 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3520  putative plasmid stability protein StbC  100 
 
 		 84 aa  166  9e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743208 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1215  putative plasmid stability protein StbC  100 
 
 		 84 aa  166  9e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2333  plasmid stabilization protein  73.81 
 
 		 84 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.209572 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3888  hypothetical protein  71.43 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7720  plasmid stability protein  71.08 
 
 		 84 aa  120  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4675  hypothetical protein  67.86 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3137  plasmid stabilization protein  66.67 
 
 		 84 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384782  normal  0.487759 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5670  plasmid stability protein-like protein  62.96 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3454  plasmid stabilization protein  63.86 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4765  plasmid stabilization protein  59.52 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.218672 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5842  plasmid stability protein StbC  61.18 
 
 		 85 aa  102  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1779  plasmid stability protein, putative  54.76 
 
 		 84 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3193  putative plasmid stabilization protein  61.18 
 
 		 87 aa  98.6  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1455  plasmid stability protein-like protein  54.76 
 
 		 84 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0948789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2303  plasmid stabilization protein  57.14 
 
 		 84 aa  99  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320056  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3768  plasmid stability protein StbC  53.57 
 
 		 84 aa  97.1  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.411403  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3028  hypothetical protein  58.33 
 
 		 84 aa  96.7  9e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0118317 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4335  plasmid stability protein StbC  55.95 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3570  hypothetical protein  59.52 
 
 		 83 aa  95.1  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0468  plasmid stability protein StbC  52.94 
 
 		 85 aa  94.7  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0895  plasmid stability protein-like  58.33 
 
 		 91 aa  94.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3475  plasmid stability protein StbC  56.47 
 
 		 85 aa  93.2  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.269317 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3796  Arc domain-containing protein  57.14 
 
 		 79 aa  92.8  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226949 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4189  plasmid stability protein-like protein  53.57 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.848432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0727  plasmid stability protein StbC  52.94 
 
 		 85 aa  89  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.460533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4711  plasmid stability protein-like protein  53.57 
 
 		 91 aa  87.4  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.5275 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0019  plasmid stability protein StbC  48.78 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0380378  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36410  plasmid stability protein StbC  54.29 
 
 		 71 aa  77  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.937788  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2074  putative plasmid stability protein  45.24 
 
 		 79 aa  65.1  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0207391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0629  hypothetical protein  43.94 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302428 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4618  hypothetical protein  38.82 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3181  hypothetical protein  44.32 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1722  putative stabilization protein  57.14 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4027  Resolvase domain protein  44.74 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4020  hypothetical protein  37.88 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6536  putative plasmid stability protein  57.5 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0896762 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2641  hypothetical protein  48.33 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23560  hypothetical protein  42.86 
 
 		 81 aa  45.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.459233  normal  0.445155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4150  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1544  panthotenate metabolism flavoprotein  41.94 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070081 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3696  hypothetical protein  55 
 
 		 81 aa  43.5  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0826  hypothetical protein  36.47 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.448113  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0075  hypothetical protein  42.59 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501463  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3576  hypothetical protein  41.94 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00242199  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1361  plasmid stability protein, putative  46.43 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15422  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1881  plasmid stability protein  50 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1046  hypothetical protein  42.62 
 
 		 81 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0839246  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1965  hypothetical protein  39.02 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.30169 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1593  hypothetical protein  48.39 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.714896  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>