39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3137 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3137  plasmid stabilization protein  100 
 
 		 84 aa  168  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384782  normal  0.487759 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2333  plasmid stabilization protein  85.71 
 
 		 84 aa  144  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.209572 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7720  plasmid stability protein  78.31 
 
 		 84 aa  133  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3520  putative plasmid stability protein StbC  66.67 
 
 		 84 aa  110  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743208 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1215  putative plasmid stability protein StbC  66.67 
 
 		 84 aa  110  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3888  hypothetical protein  63.1 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4675  hypothetical protein  60.71 
 
 		 87 aa  104  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3028  hypothetical protein  60.71 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0118317 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5670  plasmid stability protein-like protein  53.09 
 
 		 147 aa  94.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0727  plasmid stability protein StbC  54.12 
 
 		 85 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.460533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1779  plasmid stability protein, putative  50 
 
 		 84 aa  92.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1455  plasmid stability protein-like protein  50 
 
 		 84 aa  92.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0948789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3454  plasmid stabilization protein  53.01 
 
 		 85 aa  91.3  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3768  plasmid stability protein StbC  52.38 
 
 		 84 aa  90.1  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.411403  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0468  plasmid stability protein StbC  51.76 
 
 		 85 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5842  plasmid stability protein StbC  54.12 
 
 		 85 aa  87.4  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3570  hypothetical protein  54.76 
 
 		 83 aa  87  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4335  plasmid stability protein StbC  48.81 
 
 		 84 aa  86.7  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4189  plasmid stability protein-like protein  52.38 
 
 		 91 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.848432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4711  plasmid stability protein-like protein  52.38 
 
 		 91 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.5275 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0895  plasmid stability protein-like  52.38 
 
 		 91 aa  84  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3796  Arc domain-containing protein  53.57 
 
 		 79 aa  83.6  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226949 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3193  putative plasmid stabilization protein  54.12 
 
 		 87 aa  82.8  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2303  plasmid stabilization protein  47.62 
 
 		 84 aa  82.8  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320056  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4765  plasmid stabilization protein  47.62 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.218672 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3475  plasmid stability protein StbC  50.59 
 
 		 85 aa  77.8  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.269317 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36410  plasmid stability protein StbC  54.55 
 
 		 71 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.937788  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0019  plasmid stability protein StbC  47.06 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0380378  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2074  putative plasmid stability protein  41.67 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0207391 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1722  putative stabilization protein  55.36 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0629  hypothetical protein  43.94 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302428 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0075  hypothetical protein  58.97 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501463  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1544  panthotenate metabolism flavoprotein  42.42 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070081 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23560  hypothetical protein  38.75 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.459233  normal  0.445155 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4020  hypothetical protein  48.84 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4211  hypothetical protein  48.89 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176867  normal  0.948533 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1881  plasmid stability protein  53.49 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3696  hypothetical protein  52.5 
 
 		 81 aa  41.2  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1069  hypothetical protein  40.74 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>