61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3696 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3696  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  156  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4618  hypothetical protein  50 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0629  hypothetical protein  49.37 
 
 		 79 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302428 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1046  hypothetical protein  45.68 
 
 		 81 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0839246  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4150  hypothetical protein  52.05 
 
 		 82 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3576  hypothetical protein  48.75 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00242199  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1069  hypothetical protein  45.57 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0726  hypothetical protein  47.89 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3181  hypothetical protein  48.65 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1593  hypothetical protein  53.73 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.714896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6536  putative plasmid stability protein  50.7 
 
 		 82 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0896762 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4027  Resolvase domain protein  43.04 
 
 		 89 aa  63.5  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4020  hypothetical protein  45 
 
 		 82 aa  62  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23560  hypothetical protein  39.51 
 
 		 81 aa  62  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.459233  normal  0.445155 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1361  plasmid stability protein, putative  46.58 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15422  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1881  plasmid stability protein  40.74 
 
 		 83 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4711  plasmid stability protein-like protein  43.75 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.5275 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4189  plasmid stability protein-like protein  46.84 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.848432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3796  Arc domain-containing protein  45.57 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226949 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4675  hypothetical protein  50.79 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2796  plasmid stability protein  41.56 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.485271  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0622  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  45.57 
 
 		 485 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.476775 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1544  panthotenate metabolism flavoprotein  41.43 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070081 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1319  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  66.67 
 
 		 461 aa  51.6  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4335  plasmid stability protein StbC  60.98 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2641  hypothetical protein  42.03 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1709  hypothetical protein  43.21 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1779  plasmid stability protein, putative  58.54 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1455  plasmid stability protein-like protein  58.54 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0948789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2303  plasmid stabilization protein  60.98 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320056  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0895  plasmid stability protein-like  45.59 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0051  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  50 
 
 		 479 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0750975  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4211  hypothetical protein  38.89 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176867  normal  0.948533 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0791  hypothetical protein  51.47 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.699081  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0380  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  37.5 
 
 		 475 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5842  plasmid stability protein StbC  60 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3454  plasmid stabilization protein  54.55 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0209  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  38.75 
 
 		 485 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4765  plasmid stabilization protein  56.1 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.218672 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3768  plasmid stability protein StbC  53.66 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.411403  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5670  plasmid stability protein-like protein  56.41 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0043  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  61.11 
 
 		 479 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.658054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0727  plasmid stability protein StbC  55.81 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.460533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3475  plasmid stability protein StbC  58.97 
 
 		 85 aa  44.7  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.269317 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0084  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  56.1 
 
 		 481 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0075  hypothetical protein  50 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501463  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1215  putative plasmid stability protein StbC  55 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3520  putative plasmid stability protein StbC  55 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743208 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1965  hypothetical protein  38.46 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.30169 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2333  plasmid stabilization protein  55 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.209572 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1877  hypothetical protein  35.94 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3888  hypothetical protein  52.5 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0083  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  52.78 
 
 		 475 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317145 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1722  putative stabilization protein  54.55 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3137  plasmid stabilization protein  52.5 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384782  normal  0.487759 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3193  putative plasmid stabilization protein  53.85 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7720  plasmid stability protein  51.16 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0019  plasmid stability protein StbC  51.28 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0380378  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4588  hypothetical protein  55 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2074  putative plasmid stability protein  34.57 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0207391 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3514  hypothetical protein  55 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264165  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>