33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1709 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1709  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  161  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358653  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1877  hypothetical protein  49.35 
 
 
79 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.453683  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2641  hypothetical protein  48.05 
 
 
116 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1965  hypothetical protein  49.35 
 
 
79 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.30169 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0826  hypothetical protein  46.25 
 
 
82 aa  72  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.448113  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1046  hypothetical protein  48.78 
 
 
81 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0839246  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1361  plasmid stability protein, putative  43.9 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15422  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1069  hypothetical protein  46.25 
 
 
95 aa  53.9  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4027  Resolvase domain protein  42.68 
 
 
89 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4020  hypothetical protein  44.87 
 
 
82 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3696  hypothetical protein  43.21 
 
 
81 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4618  hypothetical protein  39.76 
 
 
87 aa  48.9  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0380  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  58.54 
 
 
475 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6536  putative plasmid stability protein  47.14 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0896762 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3570  hypothetical protein  39.77 
 
 
83 aa  47  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0726  hypothetical protein  46.38 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0791  hypothetical protein  43.59 
 
 
76 aa  45.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.699081  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4765  plasmid stabilization protein  47.62 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.218672 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4675  hypothetical protein  38.37 
 
 
87 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2074  putative plasmid stability protein  35.8 
 
 
79 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0207391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0629  hypothetical protein  42.03 
 
 
79 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.302428 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2796  plasmid stability protein  41.18 
 
 
94 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.485271  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1881  plasmid stability protein  55 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4711  plasmid stability protein-like protein  38.55 
 
 
91 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.5275 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0622  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  53.66 
 
 
485 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.476775 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0051  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  53.85 
 
 
479 aa  41.6  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0750975  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23560  hypothetical protein  45.76 
 
 
81 aa  41.6  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.459233  normal  0.445155 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3028  hypothetical protein  39.13 
 
 
84 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0118317 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3576  hypothetical protein  36.25 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00242199  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4150  hypothetical protein  38.46 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1455  plasmid stability protein-like protein  33.72 
 
 
84 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0948789  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1779  plasmid stability protein, putative  33.72 
 
 
84 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0083  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  47.73 
 
 
475 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.317145 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>