33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2641 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2641  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  237  4e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1965  hypothetical protein  82.05 
 
 
79 aa  136  8.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.30169 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1877  hypothetical protein  71.43 
 
 
79 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.453683  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0826  hypothetical protein  56.79 
 
 
82 aa  92  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.448113  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1709  hypothetical protein  48.05 
 
 
81 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358653  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1361  plasmid stability protein, putative  47.06 
 
 
97 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15422  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1069  hypothetical protein  42.68 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1046  hypothetical protein  50 
 
 
81 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0839246  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6536  putative plasmid stability protein  46.15 
 
 
82 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0896762 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3576  hypothetical protein  44.44 
 
 
81 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00242199  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4027  Resolvase domain protein  49.23 
 
 
89 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3181  hypothetical protein  47.62 
 
 
91 aa  54.3  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1593  hypothetical protein  42.67 
 
 
81 aa  53.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.714896  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4150  hypothetical protein  40.26 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23560  hypothetical protein  47.54 
 
 
81 aa  52  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.459233  normal  0.445155 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4618  hypothetical protein  41.54 
 
 
87 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2796  plasmid stability protein  50.94 
 
 
94 aa  51.6  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.485271  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3696  hypothetical protein  42.03 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1881  plasmid stability protein  44.44 
 
 
83 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4189  plasmid stability protein-like protein  49.15 
 
 
91 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.848432  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4020  hypothetical protein  39.68 
 
 
82 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0895  plasmid stability protein-like  44.83 
 
 
91 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4335  plasmid stability protein StbC  45.45 
 
 
84 aa  45.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3520  putative plasmid stability protein StbC  48.33 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.743208 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1215  putative plasmid stability protein StbC  48.33 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4711  plasmid stability protein-like protein  46.55 
 
 
91 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.5275 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3028  hypothetical protein  46.43 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0118317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0629  hypothetical protein  38.71 
 
 
79 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.302428 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0043  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  45.65 
 
 
479 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.658054 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4675  hypothetical protein  44.44 
 
 
87 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3768  plasmid stability protein StbC  46.94 
 
 
84 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.411403  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5670  plasmid stability protein-like protein  40.32 
 
 
147 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4765  plasmid stabilization protein  39.68 
 
 
84 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.218672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>