48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3028 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3028  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  166  7e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0118317 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3570  hypothetical protein  84.52 
 
 		 83 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4675  hypothetical protein  70.24 
 
 		 87 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3475  plasmid stability protein StbC  63.53 
 
 		 85 aa  104  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.269317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5842  plasmid stability protein StbC  61.18 
 
 		 85 aa  103  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2333  plasmid stabilization protein  61.9 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.209572 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3137  plasmid stabilization protein  60.71 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384782  normal  0.487759 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0468  plasmid stability protein StbC  57.65 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3888  hypothetical protein  60.71 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5670  plasmid stability protein-like protein  55.56 
 
 		 147 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0727  plasmid stability protein StbC  60 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.460533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3454  plasmid stabilization protein  56.63 
 
 		 85 aa  98.6  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2303  plasmid stabilization protein  53.57 
 
 		 84 aa  99  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320056  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4335  plasmid stability protein StbC  51.19 
 
 		 84 aa  97.8  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3520  putative plasmid stability protein StbC  58.33 
 
 		 84 aa  96.7  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743208 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1215  putative plasmid stability protein StbC  58.33 
 
 		 84 aa  96.7  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3768  plasmid stability protein StbC  53.57 
 
 		 84 aa  95.9  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.411403  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7720  plasmid stability protein  56.63 
 
 		 84 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1779  plasmid stability protein, putative  51.19 
 
 		 84 aa  95.9  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1455  plasmid stability protein-like protein  51.19 
 
 		 84 aa  95.9  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0948789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3193  putative plasmid stabilization protein  58.82 
 
 		 87 aa  94.4  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3796  Arc domain-containing protein  55.95 
 
 		 79 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226949 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4189  plasmid stability protein-like protein  54.76 
 
 		 91 aa  90.1  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.848432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0895  plasmid stability protein-like  54.76 
 
 		 91 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4765  plasmid stabilization protein  48.81 
 
 		 84 aa  88.2  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.218672 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4711  plasmid stability protein-like protein  52.38 
 
 		 91 aa  87  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.5275 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0019  plasmid stability protein StbC  50.59 
 
 		 97 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0380378  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36410  plasmid stability protein StbC  52.86 
 
 		 71 aa  75.9  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.937788  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2074  putative plasmid stability protein  47.62 
 
 		 79 aa  72  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0207391 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1722  putative stabilization protein  51.56 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1069  hypothetical protein  46 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4618  hypothetical protein  35.29 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0629  hypothetical protein  53.66 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302428 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1965  hypothetical protein  41.46 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.30169 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1361  plasmid stability protein, putative  47.27 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15422  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4020  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2641  hypothetical protein  46.43 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11981  hypothetical protein  67.65 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3902  hypothetical protein  37.18 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.960527  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0075  hypothetical protein  52.5 
 
 		 122 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501463  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4466  hypothetical protein  37.18 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3903  hypothetical protein  34.62 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4365  hypothetical protein  34.62 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5836  hypothetical protein  37.18 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1709  hypothetical protein  39.13 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1427  hypothetical protein  35.94 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23560  hypothetical protein  46.51 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.459233  normal  0.445155 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0826  hypothetical protein  36.92 
 
 		 82 aa  40  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.448113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>