52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3475 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3475  plasmid stability protein StbC  100 
 
 		 85 aa  167  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.269317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5842  plasmid stability protein StbC  82.35 
 
 		 85 aa  135  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0019  plasmid stability protein StbC  71.76 
 
 		 97 aa  121  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0380378  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0727  plasmid stability protein StbC  68.24 
 
 		 85 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.460533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0468  plasmid stability protein StbC  67.06 
 
 		 85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4675  hypothetical protein  69.41 
 
 		 87 aa  110  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1779  plasmid stability protein, putative  63.53 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1455  plasmid stability protein-like protein  63.53 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0948789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5670  plasmid stability protein-like protein  63.1 
 
 		 147 aa  107  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3028  hypothetical protein  63.53 
 
 		 84 aa  104  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0118317 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3768  plasmid stability protein StbC  63.53 
 
 		 84 aa  104  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.411403  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2303  plasmid stabilization protein  62.35 
 
 		 84 aa  102  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320056  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3193  putative plasmid stabilization protein  62.79 
 
 		 87 aa  99.4  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4335  plasmid stability protein StbC  61.18 
 
 		 84 aa  99  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4189  plasmid stability protein-like protein  62.35 
 
 		 91 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.848432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3454  plasmid stabilization protein  60.71 
 
 		 85 aa  97.8  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3796  Arc domain-containing protein  62.35 
 
 		 79 aa  97.8  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226949 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0895  plasmid stability protein-like  60 
 
 		 91 aa  97.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3570  hypothetical protein  61.18 
 
 		 83 aa  97.1  7e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4765  plasmid stabilization protein  58.82 
 
 		 84 aa  96.7  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.218672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3888  hypothetical protein  56.47 
 
 		 89 aa  94.7  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4711  plasmid stability protein-like protein  60 
 
 		 91 aa  93.6  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.5275 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3520  putative plasmid stability protein StbC  56.47 
 
 		 84 aa  93.2  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743208 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1215  putative plasmid stability protein StbC  56.47 
 
 		 84 aa  93.2  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2333  plasmid stabilization protein  56.47 
 
 		 84 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.209572 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36410  plasmid stability protein StbC  66.2 
 
 		 71 aa  89.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.937788  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7720  plasmid stability protein  52.38 
 
 		 84 aa  83.6  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3137  plasmid stabilization protein  50.59 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384782  normal  0.487759 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2074  putative plasmid stability protein  47.06 
 
 		 79 aa  68.2  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0207391 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1722  putative stabilization protein  58.33 
 
 		 63 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0629  hypothetical protein  48.39 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302428 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6536  putative plasmid stability protein  52.08 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0896762 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1069  hypothetical protein  40.32 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1427  hypothetical protein  45.45 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23560  hypothetical protein  47.06 
 
 		 81 aa  45.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.459233  normal  0.445155 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3696  hypothetical protein  58.97 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5836  hypothetical protein  42.67 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1361  plasmid stability protein, putative  47.27 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15422  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3902  hypothetical protein  42.67 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.960527  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4466  hypothetical protein  42.67 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4365  hypothetical protein  41.33 
 
 		 78 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3903  hypothetical protein  41.33 
 
 		 78 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4020  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4618  hypothetical protein  39.53 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1544  panthotenate metabolism flavoprotein  52.38 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070081 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4150  hypothetical protein  56.41 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1046  hypothetical protein  43.55 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0839246  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4588  hypothetical protein  45.45 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1881  plasmid stability protein  53.85 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3514  hypothetical protein  45.45 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3181  hypothetical protein  56.41 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0380  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  50 
 
 		 475 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>