50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5670 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5670  plasmid stability protein-like protein  100 
 
 		 147 aa  291  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1779  plasmid stability protein, putative  75.61 
 
 		 84 aa  131  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1455  plasmid stability protein-like protein  75.61 
 
 		 84 aa  131  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0948789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2303  plasmid stabilization protein  72.29 
 
 		 84 aa  128  3e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320056  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4765  plasmid stabilization protein  67.47 
 
 		 84 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.218672 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3454  plasmid stabilization protein  66.27 
 
 		 85 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4675  hypothetical protein  62.65 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3768  plasmid stability protein StbC  60.49 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.411403  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1215  putative plasmid stability protein StbC  62.96 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3520  putative plasmid stability protein StbC  62.96 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743208 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4335  plasmid stability protein StbC  61.45 
 
 		 84 aa  108  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2333  plasmid stabilization protein  60.49 
 
 		 84 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.209572 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3475  plasmid stability protein StbC  63.1 
 
 		 85 aa  107  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.269317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5842  plasmid stability protein StbC  64.29 
 
 		 85 aa  106  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3888  hypothetical protein  60.49 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3028  hypothetical protein  55.56 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0118317 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0468  plasmid stability protein StbC  57.32 
 
 		 85 aa  100  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0727  plasmid stability protein StbC  58.33 
 
 		 85 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.460533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7720  plasmid stability protein  56.25 
 
 		 84 aa  98.6  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3570  hypothetical protein  54.32 
 
 		 83 aa  97.4  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3796  Arc domain-containing protein  60.98 
 
 		 79 aa  97.4  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226949 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0019  plasmid stability protein StbC  50 
 
 		 97 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0380378  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3193  putative plasmid stabilization protein  54.88 
 
 		 87 aa  95.5  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3137  plasmid stabilization protein  53.09 
 
 		 84 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384782  normal  0.487759 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4189  plasmid stability protein-like protein  57.32 
 
 		 91 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.848432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36410  plasmid stability protein StbC  58.57 
 
 		 71 aa  92  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.937788  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0895  plasmid stability protein-like  57.32 
 
 		 91 aa  92  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4711  plasmid stability protein-like protein  53.41 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.5275 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2074  putative plasmid stability protein  45.78 
 
 		 79 aa  70.1  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0207391 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1722  putative stabilization protein  50.85 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4020  hypothetical protein  46.15 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4150  hypothetical protein  56.41 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0629  hypothetical protein  47.62 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302428 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0075  hypothetical protein  46.67 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501463  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23560  hypothetical protein  61.54 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.459233  normal  0.445155 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3181  hypothetical protein  57.14 
 
 		 91 aa  47  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1544  panthotenate metabolism flavoprotein  59.52 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070081 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3576  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00242199  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3696  hypothetical protein  56.41 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1361  plasmid stability protein, putative  43.08 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15422  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1881  plasmid stability protein  50 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1593  hypothetical protein  53.85 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.714896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6536  putative plasmid stability protein  53.85 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0896762 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2796  plasmid stability protein  44.83 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.485271  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4027  Resolvase domain protein  56.41 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1046  hypothetical protein  46.94 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0839246  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4211  hypothetical protein  54.76 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176867  normal  0.948533 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1069  hypothetical protein  41.07 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2641  hypothetical protein  40.32 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4618  hypothetical protein  40 
 
 		 87 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>