64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4618 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4618  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  179  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1046  hypothetical protein  56.1 
 
 		 81 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0839246  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3181  hypothetical protein  63.01 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1069  hypothetical protein  56.76 
 
 		 95 aa  85.5  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0726  hypothetical protein  54.79 
 
 		 75 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1361  plasmid stability protein, putative  50 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15422  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3696  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  72.8  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23560  hypothetical protein  45.95 
 
 		 81 aa  72  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.459233  normal  0.445155 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3576  hypothetical protein  52.78 
 
 		 81 aa  71.6  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00242199  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4150  hypothetical protein  53.52 
 
 		 82 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0629  hypothetical protein  51.25 
 
 		 79 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302428 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1544  panthotenate metabolism flavoprotein  48.57 
 
 		 83 aa  70.5  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070081 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1593  hypothetical protein  54.55 
 
 		 81 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.714896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6536  putative plasmid stability protein  50 
 
 		 82 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0896762 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4027  Resolvase domain protein  45.83 
 
 		 89 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1881  plasmid stability protein  45.57 
 
 		 83 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3796  Arc domain-containing protein  49.38 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226949 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4020  hypothetical protein  41.98 
 
 		 82 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4189  plasmid stability protein-like protein  44.44 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.848432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4711  plasmid stability protein-like protein  50 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.5275 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4335  plasmid stability protein StbC  47.06 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1319  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  69.44 
 
 		 461 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0895  plasmid stability protein-like  44.44 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0622  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  40.96 
 
 		 485 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.476775 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2641  hypothetical protein  41.54 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0051  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  43.1 
 
 		 479 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0750975  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1455  plasmid stability protein-like protein  39.56 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0948789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1779  plasmid stability protein, putative  39.56 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1965  hypothetical protein  38.71 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.30169 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3768  plasmid stability protein StbC  41.18 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.411403  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0043  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  55.56 
 
 		 479 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.658054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1709  hypothetical protein  39.76 
 
 		 81 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0727  plasmid stability protein StbC  40.7 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.460533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0687  hypothetical protein  36.99 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.153428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3520  putative plasmid stability protein StbC  38.82 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743208 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3454  plasmid stabilization protein  41.86 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1215  putative plasmid stability protein StbC  38.82 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2796  plasmid stability protein  32.05 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.485271  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4211  hypothetical protein  38.96 
 
 		 81 aa  47  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176867  normal  0.948533 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0468  plasmid stability protein StbC  40.7 
 
 		 85 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0084  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  53.49 
 
 		 481 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0209  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  45.45 
 
 		 485 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3028  hypothetical protein  35.29 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0118317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5842  plasmid stability protein StbC  40.7 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1877  hypothetical protein  38.98 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0019  plasmid stability protein StbC  37.21 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0380378  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0083  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  51.35 
 
 		 475 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317145 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0826  hypothetical protein  36.92 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.448113  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4675  hypothetical protein  37.65 
 
 		 87 aa  43.9  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3475  plasmid stability protein StbC  39.53 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.269317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2333  plasmid stabilization protein  35.29 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.209572 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0380  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  51.28 
 
 		 475 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2303  plasmid stabilization protein  52 
 
 		 84 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320056  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4765  plasmid stabilization protein  54 
 
 		 84 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.218672 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4365  hypothetical protein  52.5 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3903  hypothetical protein  52.5 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3902  hypothetical protein  52.5 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.960527  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5836  hypothetical protein  52.5 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4466  hypothetical protein  52.5 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0075  hypothetical protein  58.82 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501463  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1427  hypothetical protein  52.5 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0791  hypothetical protein  42.25 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.699081  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7720  plasmid stability protein  34.52 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5670  plasmid stability protein-like protein  40 
 
 		 147 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>