58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1046 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1046  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  160  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0839246  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1069  hypothetical protein  62.5 
 
 		 95 aa  99.4  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4618  hypothetical protein  56.1 
 
 		 87 aa  97.1  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1361  plasmid stability protein, putative  55 
 
 		 97 aa  84  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15422  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23560  hypothetical protein  50.62 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.459233  normal  0.445155 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4027  Resolvase domain protein  53.75 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3181  hypothetical protein  51.22 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0726  hypothetical protein  54.29 
 
 		 75 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1881  plasmid stability protein  58.9 
 
 		 83 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3696  hypothetical protein  45.68 
 
 		 81 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1544  panthotenate metabolism flavoprotein  44.44 
 
 		 83 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070081 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6536  putative plasmid stability protein  50.68 
 
 		 82 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0896762 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4150  hypothetical protein  48.78 
 
 		 82 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3576  hypothetical protein  54.17 
 
 		 81 aa  70.1  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00242199  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1593  hypothetical protein  50.67 
 
 		 81 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.714896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4020  hypothetical protein  42.17 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1709  hypothetical protein  48.78 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0629  hypothetical protein  40.51 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302428 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2641  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1877  hypothetical protein  52.54 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4711  plasmid stability protein-like protein  41.25 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.5275 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2796  plasmid stability protein  41.56 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.485271  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4189  plasmid stability protein-like protein  42.5 
 
 		 91 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.848432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3796  Arc domain-containing protein  42.5 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226949 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1965  hypothetical protein  46.27 
 
 		 79 aa  52.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.30169 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1319  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  69.44 
 
 		 461 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0051  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  48.08 
 
 		 479 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0750975  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0622  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  65 
 
 		 485 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.476775 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0895  plasmid stability protein-like  41.25 
 
 		 91 aa  50.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0209  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  67.57 
 
 		 485 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0380  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  64.1 
 
 		 475 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0084  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  59.52 
 
 		 481 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0687  hypothetical protein  41.67 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.153428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0826  hypothetical protein  43.55 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.448113  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4211  hypothetical protein  40.28 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176867  normal  0.948533 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0043  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  58.97 
 
 		 479 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.658054 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4675  hypothetical protein  42.35 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4335  plasmid stability protein StbC  40 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0791  hypothetical protein  42.65 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.699081  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0083  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  59.46 
 
 		 475 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317145 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5842  plasmid stability protein StbC  46.77 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3454  plasmid stabilization protein  39.53 
 
 		 85 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0019  plasmid stability protein StbC  39.53 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0380378  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0727  plasmid stability protein StbC  43.55 
 
 		 85 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.460533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4765  plasmid stabilization protein  43.06 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.218672 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3193  putative plasmid stabilization protein  52.94 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2333  plasmid stabilization protein  40.51 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.209572 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3888  hypothetical protein  44.12 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2303  plasmid stabilization protein  46.67 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320056  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0468  plasmid stability protein StbC  41.94 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5670  plasmid stability protein-like protein  46.94 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1455  plasmid stability protein-like protein  52.5 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0948789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3475  plasmid stability protein StbC  43.55 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.269317 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1779  plasmid stability protein, putative  52.5 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3520  putative plasmid stability protein StbC  42.62 
 
 		 84 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743208 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1215  putative plasmid stability protein StbC  42.62 
 
 		 84 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3768  plasmid stability protein StbC  36.9 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.411403  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2074  putative plasmid stability protein  33.75 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0207391 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>