64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1455 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1779  plasmid stability protein, putative  100 
 
 		 84 aa  167  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1455  plasmid stability protein-like protein  100 
 
 		 84 aa  167  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0948789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5670  plasmid stability protein-like protein  75.61 
 
 		 147 aa  131  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4765  plasmid stabilization protein  75 
 
 		 84 aa  127  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.218672 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2303  plasmid stabilization protein  71.43 
 
 		 84 aa  125  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320056  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3454  plasmid stabilization protein  67.47 
 
 		 85 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3768  plasmid stability protein StbC  64.29 
 
 		 84 aa  114  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.411403  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4335  plasmid stability protein StbC  61.9 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3475  plasmid stability protein StbC  63.53 
 
 		 85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.269317 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4675  hypothetical protein  57.14 
 
 		 87 aa  104  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2333  plasmid stabilization protein  55.95 
 
 		 84 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.209572 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3520  putative plasmid stability protein StbC  54.76 
 
 		 84 aa  99  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743208 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1215  putative plasmid stability protein StbC  54.76 
 
 		 84 aa  99  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0727  plasmid stability protein StbC  56.47 
 
 		 85 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.460533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7720  plasmid stability protein  55.42 
 
 		 84 aa  97.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5842  plasmid stability protein StbC  58.82 
 
 		 85 aa  97.4  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3888  hypothetical protein  52.38 
 
 		 89 aa  97.1  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3028  hypothetical protein  51.19 
 
 		 84 aa  95.9  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0118317 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3570  hypothetical protein  51.19 
 
 		 83 aa  93.6  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3137  plasmid stabilization protein  50 
 
 		 84 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384782  normal  0.487759 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4189  plasmid stability protein-like protein  53.57 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.848432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36410  plasmid stability protein StbC  61.43 
 
 		 71 aa  91.7  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.937788  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3796  Arc domain-containing protein  57.14 
 
 		 79 aa  90.9  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226949 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0468  plasmid stability protein StbC  52.94 
 
 		 85 aa  90.9  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3193  putative plasmid stabilization protein  51.76 
 
 		 87 aa  90.1  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0895  plasmid stability protein-like  54.76 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0019  plasmid stability protein StbC  49.41 
 
 		 97 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0380378  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4711  plasmid stability protein-like protein  52.38 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.5275 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2074  putative plasmid stability protein  48.81 
 
 		 79 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0207391 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1722  putative stabilization protein  51.9 
 
 		 63 aa  65.5  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3514  hypothetical protein  54.55 
 
 		 67 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4588  hypothetical protein  54.55 
 
 		 67 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23560  hypothetical protein  62.22 
 
 		 81 aa  50.4  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.459233  normal  0.445155 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4020  hypothetical protein  42.65 
 
 		 82 aa  50.4  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4618  hypothetical protein  39.56 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3696  hypothetical protein  58.54 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1361  plasmid stability protein, putative  47.27 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0629  hypothetical protein  48.33 
 
 		 79 aa  47.4  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302428 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0075  hypothetical protein  55.26 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501463  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1544  panthotenate metabolism flavoprotein  56.82 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070081 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6536  putative plasmid stability protein  38.96 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0896762 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4027  Resolvase domain protein  39.74 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3576  hypothetical protein  46.3 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00242199  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4211  hypothetical protein  53.33 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176867  normal  0.948533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1593  hypothetical protein  46.77 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.714896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4150  hypothetical protein  52.5 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1881  plasmid stability protein  50 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1427  hypothetical protein  40.51 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0826  hypothetical protein  43.75 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.448113  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3181  hypothetical protein  53.7 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0051  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  54.9 
 
 		 479 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0750975  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0380  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  54.76 
 
 		 475 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1046  hypothetical protein  52.5 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0839246  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1877  hypothetical protein  40.32 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1319  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  41.27 
 
 		 461 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4365  hypothetical protein  45.45 
 
 		 78 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3903  hypothetical protein  45.45 
 
 		 78 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2796  plasmid stability protein  44.07 
 
 		 94 aa  41.2  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.485271  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1069  hypothetical protein  40.82 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5836  hypothetical protein  45.45 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3902  hypothetical protein  45.45 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.960527  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4466  hypothetical protein  45.45 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11981  hypothetical protein  57.14 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1709  hypothetical protein  33.72 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358653  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>