48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3768 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3768  plasmid stability protein StbC  100 
 
 		 84 aa  167  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.411403  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36410  plasmid stability protein StbC  84.29 
 
 		 71 aa  120  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.937788  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4335  plasmid stability protein StbC  63.1 
 
 		 84 aa  118  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1455  plasmid stability protein-like protein  64.29 
 
 		 84 aa  114  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0948789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1779  plasmid stability protein, putative  64.29 
 
 		 84 aa  114  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5670  plasmid stability protein-like protein  60.49 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0468  plasmid stability protein StbC  63.53 
 
 		 85 aa  106  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3475  plasmid stability protein StbC  63.53 
 
 		 85 aa  104  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.269317 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0019  plasmid stability protein StbC  61.45 
 
 		 97 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0380378  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3193  putative plasmid stabilization protein  55.29 
 
 		 87 aa  100  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0727  plasmid stability protein StbC  58.82 
 
 		 85 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.460533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2303  plasmid stabilization protein  55.95 
 
 		 84 aa  97.4  6e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320056  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3520  putative plasmid stability protein StbC  53.57 
 
 		 84 aa  97.1  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743208 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1215  putative plasmid stability protein StbC  53.57 
 
 		 84 aa  97.1  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3028  hypothetical protein  53.57 
 
 		 84 aa  95.9  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0118317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2333  plasmid stabilization protein  54.76 
 
 		 84 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.209572 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4189  plasmid stability protein-like protein  58.33 
 
 		 91 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.848432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4675  hypothetical protein  55.95 
 
 		 87 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7720  plasmid stability protein  54.22 
 
 		 84 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4765  plasmid stabilization protein  52.38 
 
 		 84 aa  94  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.218672 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3454  plasmid stabilization protein  51.81 
 
 		 85 aa  93.6  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5842  plasmid stability protein StbC  56.47 
 
 		 85 aa  93.6  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3888  hypothetical protein  51.19 
 
 		 89 aa  93.6  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3796  Arc domain-containing protein  58.33 
 
 		 79 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226949 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0895  plasmid stability protein-like  57.14 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3137  plasmid stabilization protein  52.38 
 
 		 84 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384782  normal  0.487759 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4711  plasmid stability protein-like protein  70.69 
 
 		 91 aa  87  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.5275 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3570  hypothetical protein  50 
 
 		 83 aa  85.5  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2074  putative plasmid stability protein  41.67 
 
 		 79 aa  65.1  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0207391 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1722  putative stabilization protein  44.3 
 
 		 63 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4020  hypothetical protein  53.49 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4618  hypothetical protein  41.18 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3696  hypothetical protein  53.66 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23560  hypothetical protein  47.06 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.459233  normal  0.445155 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4211  hypothetical protein  48.89 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176867  normal  0.948533 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0826  hypothetical protein  43.08 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.448113  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1544  panthotenate metabolism flavoprotein  49.02 
 
 		 83 aa  44.3  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0629  hypothetical protein  51.22 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302428 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1069  hypothetical protein  33.75 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3181  hypothetical protein  52.5 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4027  Resolvase domain protein  36.36 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1881  plasmid stability protein  44.19 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2192  hypothetical protein  48.65 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165321  normal  0.341305 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1046  hypothetical protein  36.9 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0839246  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0075  hypothetical protein  46.15 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501463  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1361  plasmid stability protein, putative  41.82 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15422  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6536  putative plasmid stability protein  50 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0896762 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2641  hypothetical protein  46.94 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>