34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0826 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0826  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  167  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.448113  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2641  hypothetical protein  56.79 
 
 		 116 aa  92  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1965  hypothetical protein  56.41 
 
 		 79 aa  89  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.30169 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1877  hypothetical protein  48.05 
 
 		 79 aa  72  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1709  hypothetical protein  46.25 
 
 		 81 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4020  hypothetical protein  45.76 
 
 		 82 aa  52.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1361  plasmid stability protein, putative  41.79 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15422  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3576  hypothetical protein  41.46 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00242199  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4150  hypothetical protein  37.04 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1046  hypothetical protein  43.55 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0839246  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1069  hypothetical protein  41.54 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5842  plasmid stability protein StbC  41.86 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6536  putative plasmid stability protein  34.15 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0896762 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3768  plasmid stability protein StbC  43.08 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.411403  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4335  plasmid stability protein StbC  45.45 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4618  hypothetical protein  36.92 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4189  plasmid stability protein-like protein  38.75 
 
 		 91 aa  44.3  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.848432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1215  putative plasmid stability protein StbC  36.47 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3520  putative plasmid stability protein StbC  36.47 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743208 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1455  plasmid stability protein-like protein  43.75 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0948789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1779  plasmid stability protein, putative  43.75 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3193  putative plasmid stabilization protein  37.5 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2796  plasmid stability protein  39.66 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.485271  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4765  plasmid stabilization protein  43.75 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.218672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3888  hypothetical protein  35.29 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4711  plasmid stability protein-like protein  43.55 
 
 		 91 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.5275 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4027  Resolvase domain protein  41.82 
 
 		 89 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3181  hypothetical protein  34.57 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4675  hypothetical protein  39.06 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0629  hypothetical protein  34.15 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302428 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3796  Arc domain-containing protein  43.55 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226949 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3454  plasmid stabilization protein  39.06 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4211  hypothetical protein  35.8 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176867  normal  0.948533 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0895  plasmid stability protein-like  35 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>