45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3888 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3888  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  176  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7720  plasmid stability protein  72.29 
 
 		 84 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2333  plasmid stabilization protein  72.62 
 
 		 84 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.209572 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3520  putative plasmid stability protein StbC  71.43 
 
 		 84 aa  121  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743208 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1215  putative plasmid stability protein StbC  71.43 
 
 		 84 aa  121  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4675  hypothetical protein  68.24 
 
 		 87 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3137  plasmid stabilization protein  63.1 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384782  normal  0.487759 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4765  plasmid stabilization protein  60.71 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.218672 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5670  plasmid stability protein-like protein  60.49 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5842  plasmid stability protein StbC  61.18 
 
 		 85 aa  104  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3454  plasmid stabilization protein  62.65 
 
 		 85 aa  103  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3028  hypothetical protein  60.71 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0118317 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3570  hypothetical protein  61.9 
 
 		 83 aa  100  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2303  plasmid stabilization protein  57.14 
 
 		 84 aa  101  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320056  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0468  plasmid stability protein StbC  54.12 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3193  putative plasmid stabilization protein  60 
 
 		 87 aa  100  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1455  plasmid stability protein-like protein  52.38 
 
 		 84 aa  97.1  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0948789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0727  plasmid stability protein StbC  56.47 
 
 		 85 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.460533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1779  plasmid stability protein, putative  52.38 
 
 		 84 aa  97.1  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3475  plasmid stability protein StbC  56.47 
 
 		 85 aa  94.7  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.269317 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3768  plasmid stability protein StbC  51.19 
 
 		 84 aa  93.6  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.411403  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4189  plasmid stability protein-like protein  54.76 
 
 		 91 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.848432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3796  Arc domain-containing protein  51.19 
 
 		 79 aa  90.1  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226949 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4335  plasmid stability protein StbC  48.81 
 
 		 84 aa  89.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0895  plasmid stability protein-like  52.38 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4711  plasmid stability protein-like protein  52.38 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.5275 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0019  plasmid stability protein StbC  50 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0380378  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36410  plasmid stability protein StbC  54.29 
 
 		 71 aa  77.4  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.937788  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2074  putative plasmid stability protein  44.05 
 
 		 79 aa  67.8  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0207391 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1722  putative stabilization protein  46.77 
 
 		 63 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0629  hypothetical protein  42.42 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302428 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4027  Resolvase domain protein  42.86 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0075  hypothetical protein  53.85 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501463  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4020  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1069  hypothetical protein  37.04 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3696  hypothetical protein  52.5 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1046  hypothetical protein  44.12 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0839246  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1881  plasmid stability protein  52.5 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0826  hypothetical protein  35.29 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.448113  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1544  panthotenate metabolism flavoprotein  47.06 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070081 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0083  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  45.45 
 
 		 475 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317145 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23560  hypothetical protein  40 
 
 		 81 aa  41.2  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.459233  normal  0.445155 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4211  hypothetical protein  52.78 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176867  normal  0.948533 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6536  putative plasmid stability protein  52.5 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0896762 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1319  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  52.63 
 
 		 461 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>