37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3570 on replicon NC_011367
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011367  Gdia_3570  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  163  6.9999999999999995e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3028  hypothetical protein  84.52 
 
 		 84 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0118317 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4675  hypothetical protein  70.24 
 
 		 87 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3888  hypothetical protein  61.9 
 
 		 89 aa  100  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5842  plasmid stability protein StbC  60 
 
 		 85 aa  98.2  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5670  plasmid stability protein-like protein  54.32 
 
 		 147 aa  97.4  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3475  plasmid stability protein StbC  61.18 
 
 		 85 aa  97.1  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.269317 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0727  plasmid stability protein StbC  60 
 
 		 85 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.460533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3454  plasmid stabilization protein  57.83 
 
 		 85 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3796  Arc domain-containing protein  57.83 
 
 		 79 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226949 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3520  putative plasmid stability protein StbC  59.52 
 
 		 84 aa  95.1  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743208 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1215  putative plasmid stability protein StbC  59.52 
 
 		 84 aa  95.1  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3193  putative plasmid stabilization protein  58.82 
 
 		 87 aa  94.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2333  plasmid stabilization protein  58.33 
 
 		 84 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.209572 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1779  plasmid stability protein, putative  51.19 
 
 		 84 aa  93.6  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1455  plasmid stability protein-like protein  51.19 
 
 		 84 aa  93.6  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0948789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0468  plasmid stability protein StbC  55.29 
 
 		 85 aa  93.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0895  plasmid stability protein-like  56.63 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2303  plasmid stabilization protein  51.19 
 
 		 84 aa  92  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320056  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4189  plasmid stability protein-like protein  56.63 
 
 		 91 aa  90.5  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.848432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4335  plasmid stability protein StbC  51.19 
 
 		 84 aa  89.4  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4711  plasmid stability protein-like protein  53.01 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.5275 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7720  plasmid stability protein  54.22 
 
 		 84 aa  88.2  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4765  plasmid stabilization protein  50 
 
 		 84 aa  87.4  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.218672 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3137  plasmid stabilization protein  54.76 
 
 		 84 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384782  normal  0.487759 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0019  plasmid stability protein StbC  54.12 
 
 		 97 aa  87  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0380378  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3768  plasmid stability protein StbC  50 
 
 		 84 aa  85.5  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.411403  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2074  putative plasmid stability protein  50.6 
 
 		 79 aa  76.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0207391 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36410  plasmid stability protein StbC  55.71 
 
 		 71 aa  74.7  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.937788  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1722  putative stabilization protein  53.12 
 
 		 63 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1709  hypothetical protein  39.77 
 
 		 81 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0629  hypothetical protein  40.91 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302428 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0075  hypothetical protein  44.83 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501463  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1069  hypothetical protein  44 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4020  hypothetical protein  47.73 
 
 		 82 aa  41.2  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1361  plasmid stability protein, putative  45.45 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15422  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1881  plasmid stability protein  52.5 
 
 		 83 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0760602 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>