44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2074 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2074  putative plasmid stability protein  100 
 
 		 79 aa  156  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0207391 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3796  Arc domain-containing protein  49.37 
 
 		 79 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226949 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3454  plasmid stabilization protein  46.99 
 
 		 85 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0895  plasmid stability protein-like  49.37 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3570  hypothetical protein  50.6 
 
 		 83 aa  76.6  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4765  plasmid stabilization protein  51.16 
 
 		 84 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.218672 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4675  hypothetical protein  45.24 
 
 		 87 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1779  plasmid stability protein, putative  48.81 
 
 		 84 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1455  plasmid stability protein-like protein  48.81 
 
 		 84 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0948789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0468  plasmid stability protein StbC  42.35 
 
 		 85 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5842  plasmid stability protein StbC  44.71 
 
 		 85 aa  72.4  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3028  hypothetical protein  47.62 
 
 		 84 aa  72  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0118317 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2303  plasmid stabilization protein  47.67 
 
 		 84 aa  70.9  0.000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320056  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5670  plasmid stability protein-like protein  45.78 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0727  plasmid stability protein StbC  44.71 
 
 		 85 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.460533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3475  plasmid stability protein StbC  47.06 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.269317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3888  hypothetical protein  44.05 
 
 		 89 aa  67.8  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4189  plasmid stability protein-like protein  45.57 
 
 		 91 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.848432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4335  plasmid stability protein StbC  42.86 
 
 		 84 aa  67  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4711  plasmid stability protein-like protein  44.3 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.5275 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3520  putative plasmid stability protein StbC  45.24 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743208 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1215  putative plasmid stability protein StbC  45.24 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3768  plasmid stability protein StbC  41.67 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.411403  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0019  plasmid stability protein StbC  42.35 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0380378  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3137  plasmid stabilization protein  41.67 
 
 		 84 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384782  normal  0.487759 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3193  putative plasmid stabilization protein  42.35 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2333  plasmid stabilization protein  41.67 
 
 		 84 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.209572 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36410  plasmid stability protein StbC  44.29 
 
 		 71 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.937788  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7720  plasmid stability protein  39.76 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1722  putative stabilization protein  59.52 
 
 		 63 aa  51.6  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3514  hypothetical protein  36.92 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4588  hypothetical protein  36.92 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1709  hypothetical protein  35.8 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0075  hypothetical protein  62.16 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501463  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4365  hypothetical protein  42.86 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3903  hypothetical protein  42.86 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1427  hypothetical protein  46.81 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23560  hypothetical protein  37.31 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.459233  normal  0.445155 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4466  hypothetical protein  41.27 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3902  hypothetical protein  41.27 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.960527  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5836  hypothetical protein  41.27 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2796  plasmid stability protein  39.13 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.485271  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1046  hypothetical protein  33.75 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0839246  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3696  hypothetical protein  34.57 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>