61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4189 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4189  plasmid stability protein-like protein  100 
 
 		 91 aa  181  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.848432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4711  plasmid stability protein-like protein  89.01 
 
 		 91 aa  161  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.5275 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0895  plasmid stability protein-like  82.42 
 
 		 91 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3796  Arc domain-containing protein  78.48 
 
 		 79 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226949 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0727  plasmid stability protein StbC  61.18 
 
 		 85 aa  105  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.460533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0468  plasmid stability protein StbC  58.82 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0019  plasmid stability protein StbC  56.7 
 
 		 97 aa  100  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0380378  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4335  plasmid stability protein StbC  60.71 
 
 		 84 aa  100  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5842  plasmid stability protein StbC  61.18 
 
 		 85 aa  99.4  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3475  plasmid stability protein StbC  62.35 
 
 		 85 aa  98.6  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.269317 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4675  hypothetical protein  61.9 
 
 		 87 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3768  plasmid stability protein StbC  58.33 
 
 		 84 aa  95.5  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.411403  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3193  putative plasmid stabilization protein  58.82 
 
 		 87 aa  93.6  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1455  plasmid stability protein-like protein  53.57 
 
 		 84 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0948789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1779  plasmid stability protein, putative  53.57 
 
 		 84 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5670  plasmid stability protein-like protein  57.32 
 
 		 147 aa  92  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2333  plasmid stabilization protein  53.57 
 
 		 84 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.209572 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3570  hypothetical protein  56.63 
 
 		 83 aa  90.5  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3888  hypothetical protein  54.76 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7720  plasmid stability protein  54.22 
 
 		 84 aa  90.5  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3028  hypothetical protein  54.76 
 
 		 84 aa  90.1  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0118317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1215  putative plasmid stability protein StbC  53.57 
 
 		 84 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3520  putative plasmid stability protein StbC  53.57 
 
 		 84 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743208 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2303  plasmid stabilization protein  54.76 
 
 		 84 aa  89  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320056  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3137  plasmid stabilization protein  52.38 
 
 		 84 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384782  normal  0.487759 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4765  plasmid stabilization protein  51.19 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.218672 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3454  plasmid stabilization protein  51.81 
 
 		 85 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36410  plasmid stability protein StbC  76 
 
 		 71 aa  80.9  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.937788  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2074  putative plasmid stability protein  45.57 
 
 		 79 aa  67  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0207391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0629  hypothetical protein  52.24 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302428 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4618  hypothetical protein  44.44 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1069  hypothetical protein  44.74 
 
 		 95 aa  57  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1046  hypothetical protein  42.5 
 
 		 81 aa  57  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0839246  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1722  putative stabilization protein  53.33 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3696  hypothetical protein  46.84 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4027  Resolvase domain protein  42.86 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4211  hypothetical protein  43.42 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176867  normal  0.948533 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3181  hypothetical protein  43.37 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1361  plasmid stability protein, putative  35.87 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15422  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23560  hypothetical protein  61.11 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.459233  normal  0.445155 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4020  hypothetical protein  59.52 
 
 		 82 aa  47.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2641  hypothetical protein  49.15 
 
 		 116 aa  47.4  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0075  hypothetical protein  55.56 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501463  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1544  panthotenate metabolism flavoprotein  57.14 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070081 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4150  hypothetical protein  40.54 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3576  hypothetical protein  41.1 
 
 		 81 aa  45.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00242199  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5836  hypothetical protein  43.84 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4466  hypothetical protein  43.84 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3902  hypothetical protein  43.84 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.960527  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1881  plasmid stability protein  41.43 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0826  hypothetical protein  38.75 
 
 		 82 aa  44.3  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.448113  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1593  hypothetical protein  52.5 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.714896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4365  hypothetical protein  41.1 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3903  hypothetical protein  41.1 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0380  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  50 
 
 		 475 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1427  hypothetical protein  35.21 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1319  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  58.33 
 
 		 461 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0051  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  53.49 
 
 		 479 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0750975  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6536  putative plasmid stability protein  40 
 
 		 82 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0896762 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4588  hypothetical protein  40.62 
 
 		 67 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3514  hypothetical protein  40.62 
 
 		 67 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264165  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>