53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0895 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0895  plasmid stability protein-like  100 
 
 
91 aa  184  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4189  plasmid stability protein-like protein  82.42 
 
 
91 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.848432  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4711  plasmid stability protein-like protein  80.22 
 
 
91 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.5275 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3796  Arc domain-containing protein  88.61 
 
 
79 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226949 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0468  plasmid stability protein StbC  62.35 
 
 
85 aa  106  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0727  plasmid stability protein StbC  61.18 
 
 
85 aa  105  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.460533  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4335  plasmid stability protein StbC  63.1 
 
 
84 aa  102  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4675  hypothetical protein  60.71 
 
 
87 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5842  plasmid stability protein StbC  58.82 
 
 
85 aa  98.2  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3475  plasmid stability protein StbC  60 
 
 
85 aa  97.8  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.269317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1215  putative plasmid stability protein StbC  58.33 
 
 
84 aa  94.7  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3520  putative plasmid stability protein StbC  58.33 
 
 
84 aa  94.7  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.743208 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3193  putative plasmid stabilization protein  56.47 
 
 
87 aa  93.6  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2303  plasmid stabilization protein  59.52 
 
 
84 aa  93.2  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320056  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5670  plasmid stability protein-like protein  57.32 
 
 
147 aa  92  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3768  plasmid stability protein StbC  57.14 
 
 
84 aa  92.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.411403  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3570  hypothetical protein  56.63 
 
 
83 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7720  plasmid stability protein  55.42 
 
 
84 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1455  plasmid stability protein-like protein  54.76 
 
 
84 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0948789  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1779  plasmid stability protein, putative  54.76 
 
 
84 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3888  hypothetical protein  52.38 
 
 
89 aa  89.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514707  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3028  hypothetical protein  54.76 
 
 
84 aa  89.4  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0118317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2333  plasmid stabilization protein  52.38 
 
 
84 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.209572 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0019  plasmid stability protein StbC  56.1 
 
 
97 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0380378  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3454  plasmid stabilization protein  54.22 
 
 
85 aa  86.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3137  plasmid stabilization protein  52.38 
 
 
84 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384782  normal  0.487759 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36410  plasmid stability protein StbC  60.87 
 
 
71 aa  82.8  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.937788  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4765  plasmid stabilization protein  52.38 
 
 
84 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.218672 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2074  putative plasmid stability protein  49.37 
 
 
79 aa  76.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0207391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0629  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  58.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.302428 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4618  hypothetical protein  44.44 
 
 
87 aa  55.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1722  putative stabilization protein  55 
 
 
63 aa  54.7  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1046  hypothetical protein  41.25 
 
 
81 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0839246  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4020  hypothetical protein  61.9 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23560  hypothetical protein  61.11 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.459233  normal  0.445155 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3696  hypothetical protein  45.59 
 
 
81 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3181  hypothetical protein  42.17 
 
 
91 aa  47.4  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1544  panthotenate metabolism flavoprotein  43.75 
 
 
83 aa  47  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070081 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6536  putative plasmid stability protein  38.46 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0896762 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4211  hypothetical protein  53.33 
 
 
81 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176867  normal  0.948533 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1069  hypothetical protein  40.91 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1881  plasmid stability protein  39.13 
 
 
83 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2641  hypothetical protein  44.83 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1361  plasmid stability protein, putative  41.79 
 
 
97 aa  43.5  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15422  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0075  hypothetical protein  52.5 
 
 
122 aa  43.9  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501463  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4150  hypothetical protein  37.04 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4027  Resolvase domain protein  40.51 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3576  hypothetical protein  52.5 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00242199  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1319  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  58.33 
 
 
461 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11981  hypothetical protein  41.27 
 
 
71 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1593  hypothetical protein  50 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.714896  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0380  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  50 
 
 
475 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0826  hypothetical protein  35 
 
 
82 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.448113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>