45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3193 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3193  putative plasmid stabilization protein  100 
 
 		 87 aa  172  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4675  hypothetical protein  62.35 
 
 		 87 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4335  plasmid stability protein StbC  58.82 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3768  plasmid stability protein StbC  55.29 
 
 		 84 aa  100  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.411403  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3888  hypothetical protein  60 
 
 		 89 aa  100  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3475  plasmid stability protein StbC  62.79 
 
 		 85 aa  99.4  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.269317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3520  putative plasmid stability protein StbC  61.18 
 
 		 84 aa  98.6  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743208 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1215  putative plasmid stability protein StbC  61.18 
 
 		 84 aa  98.6  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3796  Arc domain-containing protein  58.82 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226949 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5670  plasmid stability protein-like protein  54.88 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5842  plasmid stability protein StbC  60.47 
 
 		 85 aa  95.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3570  hypothetical protein  58.82 
 
 		 83 aa  94.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3028  hypothetical protein  58.82 
 
 		 84 aa  94.4  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0118317 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4189  plasmid stability protein-like protein  58.82 
 
 		 91 aa  93.6  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.848432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0895  plasmid stability protein-like  56.47 
 
 		 91 aa  93.6  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0468  plasmid stability protein StbC  55.81 
 
 		 85 aa  92.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4711  plasmid stability protein-like protein  57.65 
 
 		 91 aa  90.1  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.5275 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1455  plasmid stability protein-like protein  51.76 
 
 		 84 aa  90.1  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0948789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1779  plasmid stability protein, putative  51.76 
 
 		 84 aa  90.1  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0019  plasmid stability protein StbC  55.42 
 
 		 97 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0380378  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7720  plasmid stability protein  54.65 
 
 		 84 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0727  plasmid stability protein StbC  56.98 
 
 		 85 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.460533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36410  plasmid stability protein StbC  63.77 
 
 		 71 aa  87  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.937788  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2333  plasmid stabilization protein  55.29 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.209572 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3454  plasmid stabilization protein  54.02 
 
 		 85 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2303  plasmid stabilization protein  49.41 
 
 		 84 aa  84  6e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320056  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4765  plasmid stabilization protein  50.59 
 
 		 84 aa  84  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.218672 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3137  plasmid stabilization protein  54.12 
 
 		 84 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384782  normal  0.487759 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2074  putative plasmid stability protein  42.35 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0207391 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1722  putative stabilization protein  43.75 
 
 		 63 aa  50.1  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0629  hypothetical protein  53.66 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302428 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4020  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1046  hypothetical protein  52.94 
 
 		 81 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0839246  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4211  hypothetical protein  55.56 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176867  normal  0.948533 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0826  hypothetical protein  37.5 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.448113  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1361  plasmid stability protein, putative  49.09 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15422  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0380  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  52.27 
 
 		 475 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1544  panthotenate metabolism flavoprotein  48.84 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070081 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6536  putative plasmid stability protein  56.41 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0896762 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1069  hypothetical protein  48 
 
 		 95 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23560  hypothetical protein  58.33 
 
 		 81 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.459233  normal  0.445155 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0075  hypothetical protein  51.28 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501463  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1881  plasmid stability protein  53.85 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3696  hypothetical protein  53.85 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1965  hypothetical protein  39.08 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.30169 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>