27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1965 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1965  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  160  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.30169 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2641  hypothetical protein  82.05 
 
 
116 aa  136  8.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1877  hypothetical protein  78.48 
 
 
79 aa  121  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.453683  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0826  hypothetical protein  56.41 
 
 
82 aa  89  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.448113  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1709  hypothetical protein  49.35 
 
 
81 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358653  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4150  hypothetical protein  43.75 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3576  hypothetical protein  42.31 
 
 
81 aa  54.7  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00242199  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1069  hypothetical protein  46.77 
 
 
95 aa  53.9  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1593  hypothetical protein  41.67 
 
 
81 aa  53.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.714896  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3181  hypothetical protein  48.33 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1361  plasmid stability protein, putative  41.54 
 
 
97 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15422  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1046  hypothetical protein  46.27 
 
 
81 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0839246  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6536  putative plasmid stability protein  40.32 
 
 
82 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0896762 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4027  Resolvase domain protein  43.55 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4618  hypothetical protein  38.71 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1881  plasmid stability protein  46.67 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4020  hypothetical protein  41.67 
 
 
82 aa  47.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23560  hypothetical protein  39.66 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.459233  normal  0.445155 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3028  hypothetical protein  41.46 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0118317 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3696  hypothetical protein  38.46 
 
 
81 aa  43.5  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0629  hypothetical protein  37.18 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.302428 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4335  plasmid stability protein StbC  52.63 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3520  putative plasmid stability protein StbC  39.02 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.743208 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1215  putative plasmid stability protein StbC  39.02 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3193  putative plasmid stabilization protein  39.08 
 
 
87 aa  40.8  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2796  plasmid stability protein  44.74 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.485271  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1544  panthotenate metabolism flavoprotein  45.45 
 
 
83 aa  40  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070081 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>