18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0687 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0687  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  208  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.153428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1881  plasmid stability protein  70.67 
 
 		 83 aa  104  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6536  putative plasmid stability protein  50.68 
 
 		 82 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0896762 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3181  hypothetical protein  47.3 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1069  hypothetical protein  44.05 
 
 		 95 aa  62  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4150  hypothetical protein  48 
 
 		 82 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3576  hypothetical protein  42.67 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00242199  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1593  hypothetical protein  47.76 
 
 		 81 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.714896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1046  hypothetical protein  41.67 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0839246  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4618  hypothetical protein  36.99 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2796  plasmid stability protein  34.57 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.485271  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0726  hypothetical protein  41.67 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4027  Resolvase domain protein  38.16 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4020  hypothetical protein  38.89 
 
 		 82 aa  44.3  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4211  hypothetical protein  42.67 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176867  normal  0.948533 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1361  plasmid stability protein, putative  36.36 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15422  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23560  hypothetical protein  38.89 
 
 		 81 aa  41.6  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.459233  normal  0.445155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0629  hypothetical protein  33.33 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302428 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>