32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0791 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0791  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  149  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.699081  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1069  hypothetical protein  49.25 
 
 		 95 aa  60.1  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3696  hypothetical protein  51.47 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1881  plasmid stability protein  43.59 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0726  hypothetical protein  45.59 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4027  Resolvase domain protein  43.42 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0629  hypothetical protein  47.69 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302428 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1046  hypothetical protein  42.65 
 
 		 81 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0839246  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6536  putative plasmid stability protein  41.56 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0896762 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4020  hypothetical protein  56 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2796  plasmid stability protein  40 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.485271  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3181  hypothetical protein  39.73 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4711  plasmid stability protein-like protein  41.77 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.5275 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1709  hypothetical protein  43.59 
 
 		 81 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4618  hypothetical protein  42.25 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4335  plasmid stability protein StbC  54.9 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4189  plasmid stability protein-like protein  43.04 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.848432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3028  hypothetical protein  52.94 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0118317 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0380  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  56.41 
 
 		 475 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3796  Arc domain-containing protein  43.04 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226949 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1361  plasmid stability protein, putative  41.54 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15422  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4675  hypothetical protein  50.98 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3454  plasmid stabilization protein  50 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3570  hypothetical protein  41.67 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23560  hypothetical protein  36.76 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.459233  normal  0.445155 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3768  plasmid stability protein StbC  47.06 
 
 		 84 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.411403  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0895  plasmid stability protein-like  40.51 
 
 		 91 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4150  hypothetical protein  40.28 
 
 		 82 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0043  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  51.16 
 
 		 479 aa  41.2  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.658054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0727  plasmid stability protein StbC  47.06 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.460533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2641  hypothetical protein  46.34 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3576  hypothetical protein  48.78 
 
 		 81 aa  40  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00242199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>