46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3503 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4576  AAA ATPase  100 
 
 		 345 aa  712    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3503  AAA ATPase  100 
 
 		 345 aa  712    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4741  AAA ATPase  67.69 
 
 		 335 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4716  AAA ATPase  69.21 
 
 		 344 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3185  AAA ATPase  48.47 
 
 		 338 aa  305  7e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.820352  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1982  AAA ATPase  35.37 
 
 		 382 aa  161  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.135129 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3874  AAA ATPase  33.13 
 
 		 351 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2452  AAA ATPase  29.82 
 
 		 371 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  hitchhiker  0.000127751 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1037  AAA ATPase  27.97 
 
 		 388 aa  114  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2896  hypothetical protein  28.66 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0211  hypothetical protein  28.66 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0543  hypothetical protein  28.67 
 
 		 319 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1658  ATP-binding protein  27.48 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0066  ATPase  29.67 
 
 		 492 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0192  ATPase  29.67 
 
 		 492 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.866299  normal  0.0299371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4945  ATPase  29.67 
 
 		 492 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.206072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1714  ATPase  29.67 
 
 		 492 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1331  ATPase  29.67 
 
 		 492 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3569  AAA ATPase  28.75 
 
 		 338 aa  99  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.628974 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4431  hypothetical protein  26.3 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0466568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5370  AAA ATPase  28.57 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.424012 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  27.24 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  25.69 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  25.69 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6596  TniB family protein  25.8 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6260  TniB  25.09 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2603  AAA ATPase  27.27 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0342788  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06218  hypothetical protein  22.46 
 
 		 326 aa  53.1  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0057  transposition helper protein  26.01 
 
 		 296 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4686  TniB family protein  26.29 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.60041  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  25.75 
 
 		 308 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  25.19 
 
 		 296 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2647  TniB family protein  24.39 
 
 		 298 aa  49.3  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288166  normal  0.0374868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2172  TniB family protein  24.39 
 
 		 298 aa  49.3  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1347  TniB family protein  24.39 
 
 		 298 aa  49.3  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1223  TniB family protein  24.39 
 
 		 298 aa  49.3  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  25.9 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  26.79 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  26.79 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  26.79 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  26.79 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  25.9 
 
 		 302 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  25.9 
 
 		 302 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  25.9 
 
 		 302 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3048  TniB  23.35 
 
 		 303 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27260  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.12 
 
 		 730 aa  42.7  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0467711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>