78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06218 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06218  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  672    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  29.11 
 
 		 312 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0376  hypothetical protein  26.37 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  27.4 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  28.19 
 
 		 319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  28.19 
 
 		 319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  28.19 
 
 		 319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  28.19 
 
 		 319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2603  AAA ATPase  29.2 
 
 		 377 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0342788  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5057  hypothetical protein  26.55 
 
 		 312 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4199  hypothetical protein  25.68 
 
 		 340 aa  95.9  9e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5217  hypothetical protein  26.18 
 
 		 312 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.213042 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3151  hypothetical protein  26.18 
 
 		 312 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  23.94 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3861  hypothetical protein  24.48 
 
 		 319 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4721  AAA ATPase  25.08 
 
 		 327 aa  90.5  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.068339 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0017  hypothetical protein  26.79 
 
 		 335 aa  86.7  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2351  hypothetical protein  25.79 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363942 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  27.31 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  24.56 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6260  TniB  26.24 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  24.12 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4580  TniB  27.62 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6596  TniB family protein  24.89 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4686  TniB family protein  25.1 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.60041  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  25.1 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3048  TniB  25.65 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  22.88 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  22.88 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0057  transposition helper protein  26.7 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  24.7 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1174  transposition protein TniB  27.88 
 
 		 302 aa  67  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  25.99 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1223  TniB family protein  25.2 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1347  TniB family protein  25.2 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2172  TniB family protein  25.2 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2647  TniB family protein  25.2 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288166  normal  0.0374868 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  25.55 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  25.55 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  25.55 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  22.83 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0029  transposition helper protein  24.81 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4753  hypothetical protein  25.49 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  24.69 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  24.69 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  24.69 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  24.69 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2266  hypothetical protein  20.21 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1630  hypothetical protein  23.43 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0694  TniB  20.77 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0219  TniB family protein  27.48 
 
 		 325 aa  55.1  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.858856  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1591  TniB  20.77 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.545721  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3503  AAA ATPase  22.46 
 
 		 345 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4576  AAA ATPase  22.46 
 
 		 345 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  21.66 
 
 		 301 aa  52.8  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  21.66 
 
 		 301 aa  52.8  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  22.5 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  24.27 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1703  hypothetical protein  20.55 
 
 		 322 aa  50.4  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2132  TniB family protein  23.45 
 
 		 203 aa  50.4  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.521965  normal  0.0287257 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  23.18 
 
 		 301 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1151  hypothetical protein  23.21 
 
 		 278 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275843 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3660  hypothetical protein  24.03 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0976  TniB family protein  22.32 
 
 		 276 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1341  hypothetical protein  24.22 
 
 		 268 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.720259  normal  0.280158 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1982  AAA ATPase  22.91 
 
 		 382 aa  47  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.135129 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06977  hypothetical protein  29.03 
 
 		 196 aa  46.6  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0215  XRE family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 296 aa  45.8  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.046425  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2200  uncharacterized ATPase putative transposase  23.48 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3128  uncharacterized ATPase putative transposase  23.48 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.765042 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5461  TniB family protein  21.12 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.93146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1658  ATP-binding protein  21.47 
 
 		 371 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88040  part of small (ribosomal) subunit (SSU) processosome (contains U3 snoRNA) ExtraCellular Mutant DEAH-box protein involved in ribosome synthesis  31.88 
 
 		 1270 aa  43.9  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0404872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0697  general secretion pathway protein-related protein  25.23 
 
 		 298 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4741  AAA ATPase  24.64 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  27.13 
 
 		 372 aa  42.7  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1518  hypothetical protein  25.55 
 
 		 351 aa  42.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558401  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  27.14 
 
 		 497 aa  42.4  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>