22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3185 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3185  AAA ATPase  100 
 
 
338 aa  696    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.820352  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3503  AAA ATPase  48.47 
 
 
345 aa  305  7e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4576  AAA ATPase  48.47 
 
 
345 aa  305  7e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4741  AAA ATPase  46.67 
 
 
335 aa  293  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4716  AAA ATPase  45.25 
 
 
344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132435  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1982  AAA ATPase  31.91 
 
 
382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.135129 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2452  AAA ATPase  31.8 
 
 
371 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  hitchhiker  0.000127751 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3874  AAA ATPase  29.1 
 
 
351 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2896  hypothetical protein  28.65 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0211  hypothetical protein  28.65 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0543  hypothetical protein  28.04 
 
 
319 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1037  AAA ATPase  25.33 
 
 
388 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0066  ATPase  29.15 
 
 
492 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4945  ATPase  29.15 
 
 
492 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.206072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1714  ATPase  29.15 
 
 
492 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1331  ATPase  29.15 
 
 
492 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0192  ATPase  29.15 
 
 
492 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.866299  normal  0.0299371 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1658  ATP-binding protein  23.76 
 
 
371 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4431  hypothetical protein  23.51 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0466568  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3569  AAA ATPase  24.61 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.628974 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5370  AAA ATPase  28.29 
 
 
242 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.424012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2537  hypothetical protein  26.54 
 
 
357 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>