30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0211 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_2896  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  742    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0211  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  742    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3874  AAA ATPase  44.44 
 
 		 351 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4741  AAA ATPase  30.67 
 
 		 335 aa  126  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3185  AAA ATPase  28.65 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.820352  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4716  AAA ATPase  27.36 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3503  AAA ATPase  28.66 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4576  AAA ATPase  28.66 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1982  AAA ATPase  25.23 
 
 		 382 aa  102  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.135129 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0543  hypothetical protein  26.48 
 
 		 319 aa  91.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2452  AAA ATPase  28.24 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  hitchhiker  0.000127751 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3569  AAA ATPase  27.36 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.628974 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0066  ATPase  24.43 
 
 		 492 aa  73.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0192  ATPase  24.43 
 
 		 492 aa  73.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.866299  normal  0.0299371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4945  ATPase  24.43 
 
 		 492 aa  73.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.206072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1714  ATPase  24.43 
 
 		 492 aa  73.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1331  ATPase  24.43 
 
 		 492 aa  73.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4431  hypothetical protein  22.97 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0466568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1658  ATP-binding protein  22.93 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1037  AAA ATPase  22.76 
 
 		 388 aa  67  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5370  AAA ATPase  25 
 
 		 242 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.424012 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  26.16 
 
 		 301 aa  46.2  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  26.32 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  25.23 
 
 		 319 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  25.23 
 
 		 319 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  25.23 
 
 		 319 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  25.23 
 
 		 319 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  21.9 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  26.04 
 
 		 301 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  26.04 
 
 		 301 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>