56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1982 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1982  AAA ATPase  100 
 
 
382 aa  781    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.135129 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2452  AAA ATPase  39.47 
 
 
371 aa  242  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  hitchhiker  0.000127751 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0066  ATPase  36.87 
 
 
492 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0192  ATPase  36.87 
 
 
492 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.866299  normal  0.0299371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1331  ATPase  36.87 
 
 
492 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1714  ATPase  36.87 
 
 
492 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4945  ATPase  36.87 
 
 
492 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.206072 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1037  AAA ATPase  30.71 
 
 
388 aa  192  7e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1658  ATP-binding protein  31.99 
 
 
371 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4741  AAA ATPase  35.12 
 
 
335 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3185  AAA ATPase  31.91 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.820352  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4576  AAA ATPase  35.37 
 
 
345 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3503  AAA ATPase  35.37 
 
 
345 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4716  AAA ATPase  33.54 
 
 
344 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132435  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5370  AAA ATPase  36.99 
 
 
242 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.424012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0543  hypothetical protein  29.58 
 
 
319 aa  127  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3874  AAA ATPase  29.39 
 
 
351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3569  AAA ATPase  27.97 
 
 
338 aa  113  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.628974 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2896  hypothetical protein  25.23 
 
 
356 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0211  hypothetical protein  25.23 
 
 
356 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4431  hypothetical protein  27.76 
 
 
396 aa  102  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0466568  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  27.84 
 
 
300 aa  69.3  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3048  TniB  24.76 
 
 
303 aa  60.5  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  24.92 
 
 
301 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  24.92 
 
 
301 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  24.16 
 
 
289 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  24.16 
 
 
289 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  26.22 
 
 
293 aa  56.2  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4686  TniB family protein  27.92 
 
 
301 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.60041  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6596  TniB family protein  23.23 
 
 
289 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  27.85 
 
 
319 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  27.85 
 
 
319 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  27.85 
 
 
319 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  27.85 
 
 
319 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  24.35 
 
 
301 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  24.84 
 
 
298 aa  50.8  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  24.35 
 
 
301 aa  49.7  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  24.34 
 
 
301 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4199  hypothetical protein  24.39 
 
 
340 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06218  hypothetical protein  22.91 
 
 
326 aa  47  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0057  transposition helper protein  24.01 
 
 
296 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4235  hypothetical protein  20.92 
 
 
292 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.814526 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  24.68 
 
 
312 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4393  TniB  25.36 
 
 
292 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1115  Tn7-like transposition protein C  31.76 
 
 
551 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1341  hypothetical protein  24.9 
 
 
268 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.720259  normal  0.280158 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  28.32 
 
 
304 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0029  transposition helper protein  27.17 
 
 
311 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2647  TniB family protein  22.46 
 
 
298 aa  44.3  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288166  normal  0.0374868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2172  TniB family protein  22.46 
 
 
298 aa  44.3  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1347  TniB family protein  22.46 
 
 
298 aa  44.3  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1223  TniB family protein  22.46 
 
 
298 aa  44.3  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5461  TniB family protein  26.47 
 
 
297 aa  43.1  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.93146  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  27.21 
 
 
294 aa  43.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0017  hypothetical protein  24.84 
 
 
335 aa  43.1  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0976  TniB family protein  25.61 
 
 
276 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104789 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>