41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1115 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1872  Tn7-like transposition protein C  59.67 
 
 		 551 aa  668    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1115  Tn7-like transposition protein C  100 
 
 		 551 aa  1134    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0176  Tn7-like transposition protein C  48 
 
 		 550 aa  488  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2325  Tn7-like transposition protein C  42.75 
 
 		 568 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000840963 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3949  Tn7-like transposition protein C  42.4 
 
 		 565 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0184  Tn7-like transposition protein C  40.81 
 
 		 555 aa  426  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3488  Tn7-like transposition protein C  42.91 
 
 		 556 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00656002  normal  0.0745204 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0144  Tn7-like transposition protein C  40.11 
 
 		 559 aa  397  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3197  Tn5468, transposition protein C  38.1 
 
 		 551 aa  388  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2801  Tn7-like transposition protein C  38.1 
 
 		 551 aa  388  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3945  transposon Tn7 transposition protein TnsC  38.46 
 
 		 536 aa  385  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1203  Tn5468, transposition protein C  47.06 
 
 		 552 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4358  transposon Tn7 transposition protein TnsC  36.85 
 
 		 552 aa  355  2e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3934  AAA ATPase  36.8 
 
 		 546 aa  343  4e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0247  AAA ATPase  43.14 
 
 		 562 aa  341  2e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.472515 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3826  transposon Tn7 transposition protein TnsC  37.23 
 
 		 545 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109282 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5723  Tn7-like transposition protein C  41.65 
 
 		 488 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3952  Tn7-like transposition protein C  41.5 
 
 		 500 aa  327  5e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2930  hypothetical protein  40.59 
 
 		 530 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5193  Tn7-like transposition protein C  37.7 
 
 		 467 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7025  Tn7-like transposition protein C  41.28 
 
 		 352 aa  289  8e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6967  Tn7-like transposition protein C  32.32 
 
 		 540 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4322  hypothetical protein  33.51 
 
 		 478 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6941  hypothetical protein  30.6 
 
 		 470 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0945854  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2206  hypothetical protein  43.35 
 
 		 234 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3107  transposon Tn7 transposition protein C  27.43 
 
 		 490 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0459795 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1176  hypothetical protein  26.01 
 
 		 485 aa  99.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4972  hypothetical protein  24.82 
 
 		 549 aa  98.2  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  24.17 
 
 		 300 aa  57  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2172  TniB family protein  23.67 
 
 		 298 aa  55.1  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1223  TniB family protein  23.67 
 
 		 298 aa  55.1  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1347  TniB family protein  23.67 
 
 		 298 aa  55.1  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2647  TniB family protein  23.67 
 
 		 298 aa  55.1  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288166  normal  0.0374868 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  23.33 
 
 		 304 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4721  AAA ATPase  22.79 
 
 		 327 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.068339 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  25.49 
 
 		 296 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3048  TniB  30.22 
 
 		 303 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  24.1 
 
 		 294 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1982  AAA ATPase  31.76 
 
 		 382 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.135129 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0057  transposition helper protein  23.23 
 
 		 296 aa  45.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0497  hypothetical protein  23.66 
 
 		 377 aa  43.9  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129503  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>