27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1714 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007410  Ava_B0066  ATPase  100 
 
 
492 aa  1018    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0192  ATPase  100 
 
 
492 aa  1018    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.866299  normal  0.0299371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1331  ATPase  100 
 
 
492 aa  1018    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1714  ATPase  100 
 
 
492 aa  1018    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4945  ATPase  100 
 
 
492 aa  1018    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.206072 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2452  AAA ATPase  37.5 
 
 
371 aa  210  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  hitchhiker  0.000127751 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1982  AAA ATPase  36.28 
 
 
382 aa  197  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.135129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1658  ATP-binding protein  30.9 
 
 
371 aa  163  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1037  AAA ATPase  30.46 
 
 
388 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4741  AAA ATPase  29.28 
 
 
335 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3185  AAA ATPase  29.15 
 
 
338 aa  101  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.820352  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3503  AAA ATPase  29.67 
 
 
345 aa  101  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4576  AAA ATPase  29.67 
 
 
345 aa  101  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4716  AAA ATPase  28.14 
 
 
344 aa  99  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132435  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0543  hypothetical protein  26.27 
 
 
319 aa  95.5  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5370  AAA ATPase  30.89 
 
 
242 aa  93.6  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.424012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4431  hypothetical protein  26.63 
 
 
396 aa  80.5  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0466568  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0211  hypothetical protein  24.43 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2896  hypothetical protein  24.43 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3874  AAA ATPase  27.09 
 
 
351 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3569  AAA ATPase  26.33 
 
 
338 aa  69.3  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.628974 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3048  TniB  25.17 
 
 
303 aa  55.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  25.15 
 
 
319 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  25.15 
 
 
319 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7025  Tn7-like transposition protein C  22.98 
 
 
352 aa  44.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388572  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  25.15 
 
 
319 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  25.15 
 
 
319 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>