87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3259 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  100 
 
 		 289 aa  587  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  100 
 
 		 289 aa  587  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6596  TniB family protein  80.42 
 
 		 289 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6260  TniB  63.7 
 
 		 289 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4686  TniB family protein  44.07 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.60041  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4235  hypothetical protein  43.33 
 
 		 292 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.814526 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  43.22 
 
 		 286 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  43.22 
 
 		 302 aa  221  8e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  43.22 
 
 		 302 aa  221  8e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  43.22 
 
 		 302 aa  221  8e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  40.52 
 
 		 298 aa  214  9e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1174  transposition protein TniB  43.58 
 
 		 302 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  40.73 
 
 		 308 aa  208  7e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  40.82 
 
 		 293 aa  196  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  40.82 
 
 		 293 aa  196  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  40.82 
 
 		 293 aa  196  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  40.82 
 
 		 293 aa  196  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4580  TniB  37.73 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1223  TniB family protein  39.5 
 
 		 298 aa  193  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1347  TniB family protein  39.5 
 
 		 298 aa  193  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2172  TniB family protein  39.5 
 
 		 298 aa  193  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2647  TniB family protein  39.5 
 
 		 298 aa  193  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288166  normal  0.0374868 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  38.85 
 
 		 296 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  35.4 
 
 		 300 aa  189  5.999999999999999e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  36.9 
 
 		 301 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  37.5 
 
 		 301 aa  182  7e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  37.13 
 
 		 301 aa  182  7e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  36.33 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  36.33 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  35.97 
 
 		 294 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  34.41 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0057  transposition helper protein  35 
 
 		 296 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  41.06 
 
 		 497 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5461  TniB family protein  37.5 
 
 		 297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.93146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3048  TniB  35.11 
 
 		 303 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1591  TniB  29.18 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.545721  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0694  TniB  29.18 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4287  TniB  41.15 
 
 		 440 aa  139  7e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105258  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0219  TniB family protein  26.59 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.858856  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2132  TniB family protein  34.36 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.521965  normal  0.0287257 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4393  TniB  30.11 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4507  TniB  31.29 
 
 		 296 aa  92  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5455  hypothetical protein  41.51 
 
 		 135 aa  90.1  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.201732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0976  TniB family protein  27.78 
 
 		 276 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2187  hypothetical protein  29.24 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5454  TniB  32.12 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.487668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1151  hypothetical protein  27.78 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275843 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2982  TniB family protein  29.36 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06218  hypothetical protein  22.88 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  31.52 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  31.52 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  31.52 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  31.52 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  24.62 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3128  uncharacterized ATPase putative transposase  27.38 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.765042 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2200  uncharacterized ATPase putative transposase  27.38 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4716  hypothetical protein  26.41 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3503  AAA ATPase  25.69 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4576  AAA ATPase  25.69 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4741  AAA ATPase  25.86 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5217  hypothetical protein  25.21 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.213042 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3151  hypothetical protein  25.21 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5057  hypothetical protein  25.21 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1982  AAA ATPase  24.16 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.135129 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  26.07 
 
 		 312 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2603  AAA ATPase  25.65 
 
 		 377 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0342788  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3861  hypothetical protein  22.31 
 
 		 319 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3182  putative ATP/GTP-binding protein  24.47 
 
 		 337 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0026  hypothetical protein  25.52 
 
 		 379 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5592  AAA ATPase  25.4 
 
 		 393 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5416  AAA ATPase  25.4 
 
 		 393 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0612  ATP/GTP-binding protein  24.47 
 
 		 337 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.775808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3040  TniB  37.36 
 
 		 98 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4716  AAA ATPase  23.31 
 
 		 344 aa  49.7  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2266  hypothetical protein  22.92 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3660  hypothetical protein  26.92 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2351  hypothetical protein  22.31 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363942 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0543  hypothetical protein  22.85 
 
 		 319 aa  46.6  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4721  AAA ATPase  22.85 
 
 		 327 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.068339 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4753  hypothetical protein  24.18 
 
 		 362 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3107  transposon Tn7 transposition protein C  24.58 
 
 		 490 aa  45.8  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0459795 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4199  hypothetical protein  21.99 
 
 		 340 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1703  hypothetical protein  25.45 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  26.54 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3569  AAA ATPase  28.93 
 
 		 338 aa  43.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.628974 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0497  hypothetical protein  23.55 
 
 		 377 aa  43.1  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129503  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0730  transposition protein, putative  25.97 
 
 		 316 aa  43.1  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.12407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>